39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1743 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1743  Protein of unknown function DUF2219  100 
 
 
315 aa  650    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.198772  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1279  hypothetical protein  27.9 
 
 
329 aa  97.8  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.411658  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0832  hypothetical protein  27.13 
 
 
318 aa  96.7  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0580  hypothetical protein  28.39 
 
 
332 aa  91.3  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01545  hypothetical protein  32.29 
 
 
325 aa  91.3  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1241  hypothetical protein  26.45 
 
 
332 aa  88.6  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2256  Protein of unknown function DUF2219  32.22 
 
 
328 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.991484  normal  0.210769 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2001  hypothetical protein  32.81 
 
 
350 aa  87  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0581  outer membrane protein  28.57 
 
 
343 aa  86.3  7e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0569  hypothetical protein  27.07 
 
 
359 aa  84.7  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.361751  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1022  Protein of unknown function DUF2219  29.6 
 
 
353 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1384  hypothetical protein  26.4 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.368075  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3530  hypothetical protein  28.12 
 
 
367 aa  81.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.628446  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3457  hypothetical protein  28 
 
 
357 aa  81.6  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0170195  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003977  hypothetical protein  26.74 
 
 
325 aa  79.7  0.00000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2623  hypothetical protein  29.29 
 
 
359 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0801813  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0579  outer membrane protein  29.21 
 
 
338 aa  77.8  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.842627  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1299  hypothetical protein  25.38 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0279026  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3445  hypothetical protein  25.3 
 
 
357 aa  74.7  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.836811  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1458  hypothetical protein  29.75 
 
 
342 aa  73.9  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0587  hypothetical protein  27.78 
 
 
382 aa  72.8  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0641186 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1189  outer membrane protein  35.62 
 
 
330 aa  72.4  0.000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.898492  normal  0.157549 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0384  hypothetical protein  30.59 
 
 
179 aa  72.4  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0633  hypothetical protein  26.44 
 
 
319 aa  71.2  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.79269  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3051  hypothetical protein  23.05 
 
 
342 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0318572  normal  0.358656 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0106  hypothetical protein  25 
 
 
349 aa  70.1  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.256299  normal  0.169842 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1515  hypothetical protein  26.11 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0141121  hitchhiker  0.00535084 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1463  hypothetical protein  27.27 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1008  hypothetical protein  27.75 
 
 
380 aa  64.3  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1297  hypothetical protein  27.01 
 
 
399 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.328101  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1213  hypothetical protein  28.71 
 
 
365 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.660388 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1261  hypothetical protein  28.32 
 
 
375 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.220886  normal  0.0516739 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2544  hypothetical protein  28.68 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1192  hypothetical protein  26.67 
 
 
316 aa  57.8  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.955633 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0175  hypothetical protein  22.95 
 
 
319 aa  56.2  0.0000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2237  hypothetical protein  23.81 
 
 
307 aa  54.3  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07595  hypothetical protein  22.39 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.619628  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0823  hypothetical protein  25.79 
 
 
353 aa  50.8  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.0377182 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0606  hypothetical protein  27.5 
 
 
339 aa  45.8  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>