40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0622 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0622  type I restriction modification system, restriction subunit  100 
 
 		 140 aa  286  8e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2408  type III restriction enzyme, res subunit  53.85 
 
 		 907 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3852  type III restriction enzyme, res subunit  53.91 
 
 		 803 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.345387  normal  0.793201 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3779  type III restriction enzyme, res subunit  53.91 
 
 		 803 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3274  type I site-specific deoxyribonuclease  44.37 
 
 		 917 aa  97.8  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.3318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3512  type III restriction protein res subunit  45.69 
 
 		 924 aa  90.1  8e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0087  type III restriction enzyme, res subunit  40.62 
 
 		 925 aa  89.7  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.517588  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1205  hypothetical protein  45.45 
 
 		 919 aa  89  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.326173  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1495  type III restriction enzyme, res subunit  42.86 
 
 		 931 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0853  type III restriction enzyme, res subunit  44.92 
 
 		 921 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.237382  normal  0.0361479 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0509  type III restriction enzyme, res subunit  38.41 
 
 		 918 aa  85.5  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2747  type I restriction-modification system, R subunit  43.48 
 
 		 934 aa  84.7  4e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.504328  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0033  hypothetical protein  66.67 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.520432  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0605  type I restriction modification system, restriction subunit  92.5 
 
 		 44 aa  77  0.00000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.366326  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2724  type III restriction protein res subunit  32.84 
 
 		 936 aa  58.5  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1030  type III restriction enzyme, res subunit  38.26 
 
 		 893 aa  57  0.00000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0182402  normal  0.455384 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1456  type III restriction protein res subunit  35.25 
 
 		 932 aa  56.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1128  type III restriction enzyme, res subunit  34.43 
 
 		 932 aa  53.5  0.0000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3601  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  34.71 
 
 		 1137 aa  52.8  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2096  type III restriction protein res subunit  30.17 
 
 		 889 aa  52.4  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1523  DEAD/DEAH box helicase-like  30.3 
 
 		 936 aa  52  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3651  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  35.04 
 
 		 1126 aa  51.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.408969 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4243  type III restriction protein res subunit  29.63 
 
 		 933 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1098  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  34.19 
 
 		 1124 aa  49.3  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1672  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  37.08 
 
 		 1080 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1126  hypothetical protein  50 
 
 		 69 aa  46.2  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851712 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1993  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  33.71 
 
 		 1082 aa  45.1  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000937848  normal  0.215415 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0902  Type I site-specific restriction-modification system, R (restriction) subunit related helicase  31.34 
 
 		 1113 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.164801  hitchhiker  0.00000563993 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1432  type III restriction protein, res subunit  30.6 
 
 		 1108 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0831  hypothetical protein  60.61 
 
 		 35 aa  42.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0782191  normal  0.438318 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0682  hypothetical protein  60.61 
 
 		 35 aa  42.7  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3671  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  34.38 
 
 		 1174 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1664  type I site-specific deoxyribonuclease  38.57 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0650599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0160  type III restriction enzyme, res subunit  32.5 
 
 		 1137 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0444998  normal  0.740458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1238  hypothetical protein  35 
 
 		 1131 aa  40.8  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0197  type III restriction protein res subunit  32.74 
 
 		 1125 aa  40.8  0.006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000621753 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4267  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  28.79 
 
 		 1188 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2963  type I restriction enzyme EcoKI subunit R  34.07 
 
 		 1167 aa  40.4  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04216  endonuclease R  30.85 
 
 		 1170 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4190  type III restriction protein res subunit  33.03 
 
 		 1233 aa  40  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>