More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0914 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0914  ABC-type oligopeptide transport system ATPase component  100 
 
 
310 aa  635    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3653  ABC transporter related protein  62.71 
 
 
302 aa  371  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0266  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  58.5 
 
 
333 aa  338  5.9999999999999996e-92  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.196095  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1557  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  52.73 
 
 
306 aa  335  5e-91  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000215557  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1599  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  51.79 
 
 
315 aa  324  1e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1549  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  56.32 
 
 
315 aa  319  3e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0141975  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1680  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.8 
 
 
324 aa  243  3e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0218  ABC transporter related  43.75 
 
 
274 aa  236  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0918  ABC transporter related  43.68 
 
 
268 aa  218  1e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0896  ABC transporter related  43.3 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17720  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  43.63 
 
 
276 aa  211  1e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0920886  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1719  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.14 
 
 
318 aa  208  1e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5697  dipeptide transporter ATP-binding subunit  39.79 
 
 
336 aa  204  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.346178  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0234  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.85 
 
 
333 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.187354  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2745  ABC transporter related protein  41.5 
 
 
298 aa  203  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2851  ABC transporter related  36.45 
 
 
310 aa  203  3e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.148442  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5784  ABC transporter related  37.95 
 
 
299 aa  202  4e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0699295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2402  ABC transporter related  41.38 
 
 
615 aa  202  5e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6688  ABC transporter related  39.64 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157267  normal  0.337888 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0158  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.07 
 
 
327 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0386  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.98 
 
 
313 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00722146  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5077  ABC transporter related  42.42 
 
 
549 aa  199  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.704503  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1622  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.45 
 
 
319 aa  199  6e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0234356  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5079  ABC transporter related  37.67 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.377061  hitchhiker  0.00966966 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0492  ABC transporter related  41.06 
 
 
268 aa  196  3e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0085  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.47 
 
 
324 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1147  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  44.64 
 
 
336 aa  195  9e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.314064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4522  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.63 
 
 
377 aa  195  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00033475  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4104  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.89 
 
 
311 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.650723  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0202  hypothetical protein  36.58 
 
 
332 aa  194  2e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2056  ABC transporter related  39.1 
 
 
580 aa  194  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344396  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0211  hypothetical protein  36.58 
 
 
332 aa  194  2e-48  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1238  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  37.54 
 
 
311 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.454189  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000989  oligopeptide transport ATP-binding protein OppF  39.3 
 
 
310 aa  193  3e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3646  ABC transporter related  42.15 
 
 
609 aa  193  3e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2072  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.66 
 
 
348 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0237279  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1093  ABC transporter related  36.84 
 
 
311 aa  192  6e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000230358  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0042  ABC transporter related  39.47 
 
 
267 aa  192  9e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0627  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.46 
 
 
316 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1846  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.11 
 
 
450 aa  191  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.231668  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2623  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  44.02 
 
 
338 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.675572  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1371  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.95 
 
 
338 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.116668  normal  0.025409 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1796  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.26 
 
 
338 aa  190  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.749198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1105  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  36.84 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132527  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1087  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.261164  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5895  ABC transporter related  42.69 
 
 
270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1081  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0899  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.09 
 
 
345 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1195  oligopeptide ABC transporter ATP-binding protein  36.84 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0305132  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34890  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  40 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1342  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000654308  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1265  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.84 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0902  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.94 
 
 
335 aa  189  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3008  ABC transporter related  37.14 
 
 
576 aa  189  4e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.558778 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0900  ABC transporter-related protein  36.49 
 
 
311 aa  189  5e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0155747  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0849  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.2 
 
 
320 aa  189  5e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1333  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.41 
 
 
343 aa  189  5.999999999999999e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0489  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.2 
 
 
320 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1304  oligopeptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.49 
 
 
311 aa  188  8e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0835  ABC oligopeptide/dipeptide transporter, duplicated ATPase subunits  38.89 
 
 
640 aa  188  8e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.155262  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0716  ABC transporter related  39.86 
 
 
606 aa  189  8e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.953426  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3131  ABC transporter related  38.56 
 
 
640 aa  188  8e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.022829  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0845  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.46 
 
 
358 aa  188  1e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.692378  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1182  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  37.35 
 
 
333 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.637692  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2513  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  41.06 
 
 
389 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.313855  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01760  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  41.18 
 
 
584 aa  188  1e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5118  putative ABC transporter ATP-binding  39 
 
 
325 aa  188  1e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583435  normal  0.155944 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1660  oligopeptide/dipeptide ABC transporter ATPase subunit  41.09 
 
 
335 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.453104  normal  0.267068 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2011  ABC transporter component  42.35 
 
 
560 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1896  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.07 
 
 
324 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0872  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.2 
 
 
320 aa  187  2e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26140  ATPase component of various ABC-type transport systems with duplicated ATPase domain  39.76 
 
 
665 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0117472  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1218  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  35.42 
 
 
325 aa  186  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2968  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  41.74 
 
 
328 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.129298  normal  0.413022 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1802  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.68 
 
 
307 aa  186  3e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0111168  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2819  ABC transporter related  40.15 
 
 
571 aa  187  3e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.810211  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1810  ABC transporter related  40.23 
 
 
566 aa  186  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.295405  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2200  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  38.01 
 
 
332 aa  186  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.492449  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0931  ABC transporter related protein  39.11 
 
 
265 aa  186  4e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3328  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.58 
 
 
327 aa  186  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.559777  normal  0.0939424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2393  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.31 
 
 
347 aa  186  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3947  ABC transporter related  40.7 
 
 
295 aa  186  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.913784  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1405  ABC-type oligopeptide transport system, ATPase component  36.9 
 
 
309 aa  186  5e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0425  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 
323 aa  186  6e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3354  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.4 
 
 
634 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4204  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  40.4 
 
 
634 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4162  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.4 
 
 
634 aa  185  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.699138  decreased coverage  0.00270054 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0126  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  39.1 
 
 
347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110005  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5520  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (oligopeptide)  41.8 
 
 
343 aa  184  1.0000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.858577  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0988  ABC transporter related  37.82 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4026  ABC transporter related  40 
 
 
546 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal  0.697509 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3871  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  38.19 
 
 
617 aa  184  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0982  ABC transporter component  41.25 
 
 
541 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.616195  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2537  ABC transporter related  39.38 
 
 
573 aa  184  2.0000000000000003e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000203549 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0816  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  36.79 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1007  ABC transporter related  37.82 
 
 
313 aa  184  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4427  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATPase subunit  40.07 
 
 
649 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1868  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC transporter ATPase  40.07 
 
 
633 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.425351  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2174  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, ATP-binding protein-like  43.4 
 
 
326 aa  183  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.837034  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1353  ABC transporter related  39.12 
 
 
613 aa  183  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>