More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0601 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0601  serine/threonine protein kinase  100 
 
 		 360 aa  739    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.601366  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5140  serine/threonine protein kinase  36.34 
 
 		 379 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2738  serine/threonine protein kinase  38.27 
 
 		 353 aa  219  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.181367  normal  0.561641 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3510  serine/threonine protein kinase  36.65 
 
 		 363 aa  194  2e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.202915 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6001  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.96 
 
 		 607 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5304  serine/threonine protein kinase  29.75 
 
 		 763 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1382  serine/threonine protein kinase  26.24 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0031  kinase domain protein  26.6 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3775  protein kinase  25.97 
 
 		 488 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04110  calmodulin-dependent protein kinase, putative  29.24 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.93 
 
 		 602 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2313  protein kinase  30 
 
 		 1018 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000403487 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1578  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  32.1 
 
 		 602 aa  70.1  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000346283  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0171  serine/threonine protein kinase  29.11 
 
 		 575 aa  69.7  0.00000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.495174 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0362  serine/threonine protein kinase  24.89 
 
 		 632 aa  69.7  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09960  protein kinase  25.89 
 
 		 638 aa  68.9  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  30.06 
 
 		 698 aa  67.4  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26980  serine/threonine protein kinase  31.79 
 
 		 538 aa  67.4  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2208  serine/threonine protein kinase  25.62 
 
 		 877 aa  67  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.177654 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1337  PASTA sensor domain-containing serine/threonine protein kinase  31.84 
 
 		 646 aa  66.2  0.0000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00314134 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0507  serine/threonine protein kinase  27.71 
 
 		 569 aa  66.6  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.672124  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3649  serine/threonine protein kinase  27.3 
 
 		 450 aa  66.2  0.0000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.146502  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0099  serine/threonine protein kinase  25.43 
 
 		 456 aa  66.2  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.951692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5401  protein kinase  26.87 
 
 		 406 aa  66.2  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.221453  normal  0.223207 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0820  serine/threonine protein kinase  29.33 
 
 		 574 aa  65.5  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.703748  normal  0.0249792 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2304  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.4 
 
 		 632 aa  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.171539  hitchhiker  0.000365426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1235  serine/threonine protein kinase  28.15 
 
 		 628 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0016  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.283317  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00875  serine/threonine protein kinase PpkA  28.96 
 
 		 1032 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.038169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0024  protein kinase  28.57 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0108193 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0016  serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.206684 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0456  serine/threonine protein kinase  34.06 
 
 		 490 aa  64.7  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.959747  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1588  protein kinase  32.02 
 
 		 604 aa  65.1  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4733  serine/threonine protein kinase  33.71 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4688  serine/threonine protein kinase  28.85 
 
 		 520 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.414102  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.81 
 
 		 898 aa  65.1  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  31.29 
 
 		 1845 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0027  serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 		 473 aa  64.7  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_48805  predicted protein  26.26 
 
 		 457 aa  64.7  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1752  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  33.33 
 
 		 614 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6332  serine/threonine protein kinase  26.5 
 
 		 895 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00190  serine/threonine protein kinase  31.34 
 
 		 663 aa  63.9  0.000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3828  serine/threonine protein kinase  31.07 
 
 		 291 aa  63.9  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2408  serine/threonine protein kinase  26.32 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.155652  hitchhiker  0.00744313 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0642  serine/threonine protein kinase  27.27 
 
 		 519 aa  63.5  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.174048  normal  0.37866 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0008  RNA polymerase sigma factor, sigma-70 family  33.33 
 
 		 501 aa  63.5  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.273138  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  28.64 
 
 		 930 aa  63.5  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0145  serine/threonine protein kinase PpkA  29.36 
 
 		 1032 aa  63.5  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1389  protein kinase  29.17 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  0.00892717  normal  0.37108 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0319  serine/threonine protein kinase  25.62 
 
 		 651 aa  63.2  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4975  serine/threonine protein kinase  27.3 
 
 		 580 aa  63.2  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1714  protein kinase  31.4 
 
 		 621 aa  63.2  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2372  serine/threonine protein kinase  24.92 
 
 		 638 aa  62.8  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  0.0671024 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3727  protein kinase  31.85 
 
 		 569 aa  62.8  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000615107 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  30.73 
 
 		 517 aa  62.8  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7924  serine/threonine protein kinase  30.25 
 
 		 572 aa  62.8  0.000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.345293  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0329  protein kinase  25.76 
 
 		 615 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0711079  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1225  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 897 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.692846  normal  0.0133766 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  31.54 
 
 		 1833 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  26.29 
 
 		 612 aa  62.4  0.00000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3472  serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 		 407 aa  62.4  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164804  normal  0.106507 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0571  serine/threonine protein kinase  25 
 
 		 965 aa  62.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.616948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0024  protein kinase  28.57 
 
 		 430 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.448385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0811  protein kinase  29 
 
 		 436 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.630779 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5518  serine/threonine protein kinase  28.05 
 
 		 331 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.889876  normal  0.780623 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10153  MAP kinase kinase kinase (Eurofung)  27.51 
 
 		 1313 aa  62  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.701768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0438  protein kinase  26.42 
 
 		 457 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.841838  normal  0.0204841 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0028  serine/threonine protein kinase  30.51 
 
 		 464 aa  61.2  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2424  serine/threonine protein kinase  23.55 
 
 		 530 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0501957 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1957  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.07 
 
 		 668 aa  61.6  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3790  serine/threonine protein kinase  27.98 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000242747  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00190  serine/threonine protein kinase  23.71 
 
 		 596 aa  62  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0087  serine/threonine protein kinase  28.02 
 
 		 700 aa  61.2  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3707  serine/threonine protein kinase  27.98 
 
 		 480 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0812  protein kinase  28.71 
 
 		 625 aa  62  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.978056  normal  0.726926 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  34.27 
 
 		 1804 aa  60.8  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0019  serine/threonine protein kinase  27.03 
 
 		 556 aa  60.8  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2433  serine/threonine protein kinase  25.71 
 
 		 526 aa  60.8  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.263911  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  30.49 
 
 		 2051 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0026  Serine/threonine protein kinase-related protein  31.82 
 
 		 445 aa  60.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.397929  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2762  serine/threonine protein kinase  28.83 
 
 		 606 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.757983  normal  0.303991 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1225  serine/threonine protein kinase  31.35 
 
 		 612 aa  61.2  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1092  serine/threonine protein kinase  24.21 
 
 		 969 aa  61.2  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10015  transmembrane serine/threonine-protein kinase A pknA  27.04 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1111  serine/threonine protein kinase  25.1 
 
 		 527 aa  60.8  0.00000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0331309  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1554  serine/threonine protein kinase  26.26 
 
 		 710 aa  60.8  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.755932  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3844  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  24.18 
 
 		 579 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.501201  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_76263  predicted protein  25.39 
 
 		 1275 aa  60.5  0.00000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.30057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0943  serine/threonine protein kinase  28.72 
 
 		 468 aa  60.5  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00674899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1325  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  29.67 
 
 		 650 aa  60.5  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5130  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  31.72 
 
 		 518 aa  60.1  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0565421  normal  0.352944 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1392  serine/threonine kinase protein  22.37 
 
 		 623 aa  60.1  0.00000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1655  serine/threonine protein kinase  25.26 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0659373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  29.93 
 
 		 1837 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14290  serine/threonine protein kinase  27.17 
 
 		 723 aa  60.1  0.00000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275627  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND01930  conserved hypothetical protein  29.63 
 
 		 1169 aa  59.7  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3337  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.46 
 
 		 662 aa  59.7  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3747  serine/threonine protein kinase  31.95 
 
 		 619 aa  60.1  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.350974  normal  0.548904 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5395  serine/threonine protein kinase  31.97 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.300977  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2410  serine/threonine protein kinase  25.79 
 
 		 460 aa  59.7  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.378864  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>