46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1373 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_1373    100 
 
 
729 bp  1445    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3299    86.41 
 
 
773 bp  611  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000302291  decreased coverage  0.00726041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0026    88.2 
 
 
549 bp  553  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4046    87.6 
 
 
589 bp  492  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637068  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3608    83.21 
 
 
635 bp  335  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3615    87.86 
 
 
318 bp  311  2.0000000000000002e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0030    90.95 
 
 
302 bp  285  9e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171552  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0860    83.8 
 
 
443 bp  278  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3946    83.82 
 
 
486 bp  272  1e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.384523  normal  0.0272745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1391    84.07 
 
 
455 bp  246  7.999999999999999e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4682    91.67 
 
 
234 bp  222  1e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.727914  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3655    84.33 
 
 
327 bp  220  4e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0004    85.45 
 
 
399 bp  214  3e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0003    83.77 
 
 
342 bp  202  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1392  transposase  92.7 
 
 
234 bp  184  2e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3176    83.4 
 
 
300 bp  176  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.195656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0861  transposase  91.73 
 
 
210 bp  168  1.0000000000000001e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.409125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0002  IS630 family transposase  91.94 
 
 
201 bp  167  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.657549  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4851    83.16 
 
 
351 bp  165  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4850  IS630 family transposase  89.04 
 
 
153 bp  155  2e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1256  transposase  90.08 
 
 
297 bp  149  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.369513  normal  0.0252492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0926    84.65 
 
 
291 bp  149  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3656  IS630 family transposase  85.63 
 
 
180 bp  147  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0036    89.47 
 
 
216 bp  145  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137642  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3651    83.62 
 
 
294 bp  143  7.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.263475 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4164  transposase  89.68 
 
 
210 bp  139  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312743  normal  0.735246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3652  IS630 family transposase  83.9 
 
 
243 bp  137  5e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.267195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3175  IS630 family transposase  90.91 
 
 
186 bp  131  3e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4683  IS630 family transposase  85.37 
 
 
165 bp  119  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.831884  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0925  transposase  86.23 
 
 
294 bp  115  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0037  IS630 family transposase  83.95 
 
 
207 bp  107  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228515  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1267  IS630 family transposase  84.31 
 
 
168 bp  105  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590086  normal  0.0269079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3947  hypothetical protein  88.46 
 
 
150 bp  103  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.936917  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1266  hypothetical protein  92 
 
 
120 bp  93.7  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.964404  normal  0.0259834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1297  hypothetical protein  86.41 
 
 
201 bp  93.7  7e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1420  IS630 family transposase  93.1 
 
 
147 bp  83.8  0.00000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.990525  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0574  hypothetical protein  92.16 
 
 
114 bp  69.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3653  hypothetical protein  86.76 
 
 
120 bp  63.9  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3657  IS630 family transposase  89.09 
 
 
99 bp  61.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2800  transposase family protein  85.71 
 
 
848 bp  48.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4530    85.71 
 
 
2068 bp  48.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4531  transposase family protein  85.71 
 
 
848 bp  48.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0697  transposase family protein  85.71 
 
 
848 bp  48.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.294773  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1935  transposase family protein  85.71 
 
 
848 bp  48.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2885  transposase family protein  85.71 
 
 
848 bp  48.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4000  transposase family protein  85.71 
 
 
848 bp  48.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.897046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>