35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3608 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3946    92.29 
 
 
486 bp  650    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.384523  normal  0.0272745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3608    100 
 
 
635 bp  1259    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1391    95.13 
 
 
455 bp  722    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0860    92.33 
 
 
443 bp  603  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3299    88.06 
 
 
773 bp  563  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000302291  decreased coverage  0.00726041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4851    90.43 
 
 
351 bp  414  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4046    84.42 
 
 
589 bp  414  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637068  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0026    85.66 
 
 
549 bp  410  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3176    90.81 
 
 
300 bp  355  1e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.195656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0003    89.22 
 
 
342 bp  339  5.999999999999999e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0926    90.68 
 
 
291 bp  339  5.999999999999999e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1373    83.21 
 
 
729 bp  335  9e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3652  IS630 family transposase  92.77 
 
 
243 bp  331  1.0000000000000001e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.267195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0030    86.09 
 
 
302 bp  242  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171552  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0037  IS630 family transposase  98.43 
 
 
207 bp  236  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228515  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3615    91.26 
 
 
318 bp  236  6e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0002  IS630 family transposase  91.76 
 
 
201 bp  226  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.657549  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1267  IS630 family transposase  94.59 
 
 
168 bp  222  8.999999999999998e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590086  normal  0.0269079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4682    88.35 
 
 
234 bp  202  9e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.727914  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1297  hypothetical protein  88.34 
 
 
201 bp  165  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0004    90.4 
 
 
399 bp  153  7e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3657  IS630 family transposase  93.75 
 
 
99 bp  143  7e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3656  IS630 family transposase  88.62 
 
 
180 bp  133  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0042    90.43 
 
 
443 bp  115  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0925  transposase  94.52 
 
 
294 bp  113  6e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4683  IS630 family transposase  93.06 
 
 
165 bp  103  6e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.831884  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3651    90.28 
 
 
294 bp  87.7  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.263475 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1256  transposase  91.8 
 
 
297 bp  81.8  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.369513  normal  0.0252492 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2800  transposase family protein  89.29 
 
 
848 bp  63.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4530    89.29 
 
 
2068 bp  63.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4531  transposase family protein  89.29 
 
 
848 bp  63.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0697  transposase family protein  89.29 
 
 
848 bp  63.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.294773  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1935  transposase family protein  89.29 
 
 
848 bp  63.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2885  transposase family protein  89.29 
 
 
848 bp  63.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4000  transposase family protein  89.29 
 
 
848 bp  63.9  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.897046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>