23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0030 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0030    100 
 
 
302 bp  599  1e-169  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171552  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0026    96.02 
 
 
549 bp  335  4e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4046    89.14 
 
 
589 bp  325  4e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637068  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1373    90.95 
 
 
729 bp  285  3.0000000000000004e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4682    91.2 
 
 
234 bp  270  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.727914  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3299    89.57 
 
 
773 bp  250  2e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000302291  decreased coverage  0.00726041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3946    86.14 
 
 
486 bp  246  3e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.384523  normal  0.0272745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3608    86.09 
 
 
635 bp  242  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0926    86.81 
 
 
291 bp  238  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0002  IS630 family transposase  90.05 
 
 
201 bp  232  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.657549  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1391    85.43 
 
 
455 bp  226  3e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4851    84.62 
 
 
351 bp  186  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1297  hypothetical protein  88.12 
 
 
201 bp  151  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3615    90.52 
 
 
318 bp  143  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0042    92.71 
 
 
443 bp  135  7.999999999999999e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3657  IS630 family transposase  91.67 
 
 
99 bp  127  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3656  IS630 family transposase  85.71 
 
 
180 bp  125  8e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0860    88.42 
 
 
443 bp  101  1e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0037  IS630 family transposase  96.3 
 
 
207 bp  91.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228515  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3176    84.43 
 
 
300 bp  83.8  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.195656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0003    91.3 
 
 
342 bp  60  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1267  IS630 family transposase  94.29 
 
 
168 bp  54  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590086  normal  0.0269079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3653  hypothetical protein  84.62 
 
 
120 bp  50.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal  0.260401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>