39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3299 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3299    100 
 
 
773 bp  1532    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000302291  decreased coverage  0.00726041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1373    86.41 
 
 
729 bp  611  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3608    88.06 
 
 
635 bp  563  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0026    88.97 
 
 
549 bp  561  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3946    92.61 
 
 
486 bp  561  1e-157  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.384523  normal  0.0272745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0860    89.39 
 
 
443 bp  500  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1391    90.74 
 
 
455 bp  464  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4046    86.85 
 
 
589 bp  434  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637068  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3176    90.88 
 
 
300 bp  373  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.195656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0003    89.87 
 
 
342 bp  361  1.9999999999999998e-97  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0004    87.65 
 
 
399 bp  323  3.9999999999999996e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4851    88.85 
 
 
351 bp  309  6e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3615    88.89 
 
 
318 bp  297  2e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3651    88.53 
 
 
294 bp  283  4e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.263475 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0861  transposase  92.38 
 
 
210 bp  281  1e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.409125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1392  transposase  89.74 
 
 
234 bp  266  8.999999999999999e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0926    91.39 
 
 
291 bp  264  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0036    91.39 
 
 
216 bp  264  3e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137642  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3655    86.08 
 
 
327 bp  258  2.0000000000000002e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3652  IS630 family transposase  90.38 
 
 
243 bp  254  3e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.267195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0925  transposase  86.88 
 
 
294 bp  250  4.9999999999999997e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0030    89.57 
 
 
302 bp  250  4.9999999999999997e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171552  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0037  IS630 family transposase  93.83 
 
 
207 bp  234  3e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228515  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1256  transposase  86.17 
 
 
297 bp  230  5.0000000000000005e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.369513  normal  0.0252492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4682    90.58 
 
 
234 bp  228  2e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.727914  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1267  IS630 family transposase  92.02 
 
 
168 bp  212  1e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590086  normal  0.0269079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0002  IS630 family transposase  94.4 
 
 
201 bp  192  1e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.657549  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3175  IS630 family transposase  87.1 
 
 
186 bp  170  4e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3656  IS630 family transposase  87.5 
 
 
180 bp  167  6e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4164  transposase  85.24 
 
 
210 bp  163  9e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312743  normal  0.735246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3947  hypothetical protein  89.19 
 
 
150 bp  159  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.936917  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4850  IS630 family transposase  88.59 
 
 
153 bp  153  9e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1420  IS630 family transposase  90.32 
 
 
147 bp  151  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.990525  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4683  IS630 family transposase  88.59 
 
 
165 bp  145  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.831884  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0574  hypothetical protein  89.29 
 
 
114 bp  127  5e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1297  hypothetical protein  90.72 
 
 
201 bp  121  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3657  IS630 family transposase  94.23 
 
 
99 bp  79.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1266  hypothetical protein  90.14 
 
 
120 bp  77.8  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.964404  normal  0.0259834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3653  hypothetical protein  82.57 
 
 
120 bp  58  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal  0.260401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>