21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4682 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4682    100 
 
 
234 bp  464  1e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.727914  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4046    94.94 
 
 
589 bp  274  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637068  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0926    91.3 
 
 
291 bp  274  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0030    91.2 
 
 
302 bp  270  2e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171552  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3946    89.64 
 
 
486 bp  244  9e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.384523  normal  0.0272745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0002  IS630 family transposase  93.79 
 
 
201 bp  240  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.657549  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3299    90.58 
 
 
773 bp  228  5.0000000000000005e-58  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000302291  decreased coverage  0.00726041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1391    88.21 
 
 
455 bp  224  8e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1373    91.67 
 
 
729 bp  222  3e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4851    88.21 
 
 
351 bp  216  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3608    88.35 
 
 
635 bp  202  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0026    91.77 
 
 
549 bp  202  3e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1297  hypothetical protein  91.73 
 
 
201 bp  176  1.9999999999999998e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3656  IS630 family transposase  91.23 
 
 
180 bp  147  2e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3657  IS630 family transposase  93.02 
 
 
99 bp  123  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3653  hypothetical protein  87.04 
 
 
120 bp  103  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0860    93.55 
 
 
443 bp  91.7  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3615    87.63 
 
 
318 bp  89.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3176    86.67 
 
 
300 bp  75.8  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.195656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0042    92 
 
 
443 bp  67.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3769  IS630 family transposase  85.71 
 
 
405 bp  48.1  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00644408 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>