30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_1391 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3946    93.16 
 
 
486 bp  644    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.384523  normal  0.0272745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3608    95.13 
 
 
635 bp  722    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1391    100 
 
 
455 bp  902    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3299    90.74 
 
 
773 bp  464  9.999999999999999e-129  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000302291  decreased coverage  0.00726041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4851    90.99 
 
 
351 bp  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0860    94.19 
 
 
443 bp  392  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4046    86.48 
 
 
589 bp  383  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637068  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0926    92.09 
 
 
291 bp  369  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0026    88.32 
 
 
549 bp  347  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3176    90.94 
 
 
300 bp  335  6e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.195656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0037  IS630 family transposase  97.28 
 
 
207 bp  260  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228515  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0003    90.59 
 
 
342 bp  250  3e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3615    87.76 
 
 
318 bp  248  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3652  IS630 family transposase  94.41 
 
 
243 bp  248  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.267195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1373    84.07 
 
 
729 bp  246  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0002  IS630 family transposase  92.31 
 
 
201 bp  232  7e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.657549  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0030    85.43 
 
 
302 bp  226  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171552  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4682    88.21 
 
 
234 bp  224  1.9999999999999999e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.727914  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1267  IS630 family transposase  92.64 
 
 
168 bp  220  2.9999999999999998e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590086  normal  0.0269079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1297  hypothetical protein  90.38 
 
 
201 bp  182  5.999999999999999e-44  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3656  IS630 family transposase  90.24 
 
 
180 bp  149  8.000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3657  IS630 family transposase  92.05 
 
 
99 bp  119  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0042    88.3 
 
 
443 bp  99.6  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2800  transposase family protein  87.5 
 
 
848 bp  56  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4530    87.5 
 
 
2068 bp  56  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4531  transposase family protein  87.5 
 
 
848 bp  56  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0697  transposase family protein  87.5 
 
 
848 bp  56  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.294773  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1935  transposase family protein  87.5 
 
 
848 bp  56  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2885  transposase family protein  87.5 
 
 
848 bp  56  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4000  transposase family protein  87.5 
 
 
848 bp  56  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.897046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>