33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0860 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0860    100 
 
 
443 bp  878    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3608    92.33 
 
 
635 bp  603  1e-170  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3299    89.39 
 
 
773 bp  500  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000302291  decreased coverage  0.00726041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3946    95.09 
 
 
486 bp  454  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.384523  normal  0.0272745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0026    87.09 
 
 
549 bp  398  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1391    94.19 
 
 
455 bp  392  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3176    90.68 
 
 
300 bp  347  2e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.195656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3652  IS630 family transposase  92.58 
 
 
243 bp  319  4e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.267195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0003    86.39 
 
 
342 bp  293  2e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1373    83.8 
 
 
729 bp  278  1.0000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3615    87.78 
 
 
318 bp  274  2e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0037  IS630 family transposase  97.35 
 
 
207 bp  268  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228515  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4046    83.58 
 
 
589 bp  226  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637068  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4851    90.91 
 
 
351 bp  222  6e-56  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1267  IS630 family transposase  92.02 
 
 
168 bp  212  6e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590086  normal  0.0269079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0926    94.62 
 
 
291 bp  145  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3656  IS630 family transposase  88.62 
 
 
180 bp  133  5.0000000000000004e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0004    87.4 
 
 
399 bp  119  6.9999999999999995e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4683  IS630 family transposase  94.59 
 
 
165 bp  115  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.831884  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0925  transposase  92.96 
 
 
294 bp  101  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0030    88.42 
 
 
302 bp  101  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171552  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3651    91.89 
 
 
294 bp  99.6  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.263475 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4682    93.55 
 
 
234 bp  91.7  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.727914  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1256  transposase  92.06 
 
 
297 bp  85.7  0.00000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.369513  normal  0.0252492 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2800  transposase family protein  89.29 
 
 
848 bp  63.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4530    89.29 
 
 
2068 bp  63.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4531  transposase family protein  89.29 
 
 
848 bp  63.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0697  transposase family protein  89.29 
 
 
848 bp  63.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.294773  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1935  transposase family protein  89.29 
 
 
848 bp  63.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2885  transposase family protein  89.29 
 
 
848 bp  63.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4000  transposase family protein  89.29 
 
 
848 bp  63.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3653  hypothetical protein  87.1 
 
 
120 bp  60  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0389  hypothetical protein  100 
 
 
1158 bp  50.1  0.0005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.133871  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>