24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0004 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0004    100 
 
 
399 bp  791    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3299    87.65 
 
 
773 bp  323  1.9999999999999998e-86  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000302291  decreased coverage  0.00726041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3651    88.4 
 
 
294 bp  297  1e-78  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.263475 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0925  transposase  87.97 
 
 
294 bp  285  5.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1392  transposase  90.83 
 
 
234 bp  268  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0036    90.83 
 
 
216 bp  268  1e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137642  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1256  transposase  86.49 
 
 
297 bp  252  7e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.369513  normal  0.0252492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0861  transposase  89.27 
 
 
210 bp  226  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.409125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1373    85.45 
 
 
729 bp  214  1e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3175  IS630 family transposase  90.16 
 
 
186 bp  204  9.999999999999999e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3655    85.89 
 
 
327 bp  200  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4164  transposase  86.27 
 
 
210 bp  176  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312743  normal  0.735246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4683  IS630 family transposase  88.2 
 
 
165 bp  161  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.831884  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4850  IS630 family transposase  89.47 
 
 
153 bp  153  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3608    90.4 
 
 
635 bp  153  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0003    100 
 
 
342 bp  151  2.0000000000000003e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3947  hypothetical protein  87.16 
 
 
150 bp  143  3.9999999999999997e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.936917  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1420  IS630 family transposase  88.1 
 
 
147 bp  125  9.999999999999999e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.990525  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0860    87.4 
 
 
443 bp  119  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0574  hypothetical protein  90.62 
 
 
114 bp  113  4.0000000000000004e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0026    87.25 
 
 
549 bp  91.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1266  hypothetical protein  89.61 
 
 
120 bp  89.7  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.964404  normal  0.0259834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4046    88.75 
 
 
589 bp  79.8  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637068  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0123    82.18 
 
 
192 bp  58  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19105  normal  0.109067 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>