22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_4530 on replicon NC_013160
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_4000  transposase family protein  100 
 
 
848 bp  1681    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2885  transposase family protein  100 
 
 
848 bp  1681    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1935  transposase family protein  100 
 
 
848 bp  1681    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0697  transposase family protein  100 
 
 
848 bp  1681    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.294773  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4531  transposase family protein  100 
 
 
848 bp  1681    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4530    100 
 
 
2068 bp  4100    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2800  transposase family protein  100 
 
 
848 bp  1681    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4494  hypothetical protein  99.52 
 
 
1113 bp  2004    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3465    98.73 
 
 
285 bp  446  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3769  IS630 family transposase  84.21 
 
 
405 bp  69.9  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00644408 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4751  IS630 family transposase  85.19 
 
 
96 bp  65.9  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000591116  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3946    89.29 
 
 
486 bp  63.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.384523  normal  0.0272745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3608    89.29 
 
 
635 bp  63.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3176    89.29 
 
 
300 bp  63.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.195656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0860    89.29 
 
 
443 bp  63.9  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0026    87.93 
 
 
549 bp  60  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3652  IS630 family transposase  88.46 
 
 
243 bp  56  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.267195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1391    87.5 
 
 
455 bp  56  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0037  IS630 family transposase  87.5 
 
 
207 bp  56  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228515  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3615    80.91 
 
 
318 bp  52  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4851    85.71 
 
 
351 bp  48.1  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1373    85.71 
 
 
729 bp  48.1  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>