31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3946 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3946    100 
 
 
486 bp  963    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.384523  normal  0.0272745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3608    92.29 
 
 
635 bp  650    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1391    93.16 
 
 
455 bp  644    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3299    92.61 
 
 
773 bp  561  1e-158  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000302291  decreased coverage  0.00726041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0860    95.09 
 
 
443 bp  454  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4851    91.01 
 
 
351 bp  422  1e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4046    86.46 
 
 
589 bp  420  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637068  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0026    88.65 
 
 
549 bp  389  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0926    93.23 
 
 
291 bp  369  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3176    90.49 
 
 
300 bp  349  5e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.195656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3615    88.15 
 
 
318 bp  281  9e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1373    83.82 
 
 
729 bp  272  8.999999999999999e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0003    89.66 
 
 
342 bp  270  2.9999999999999995e-70  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3652  IS630 family transposase  92.51 
 
 
243 bp  260  3e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.267195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0030    86.14 
 
 
302 bp  246  5e-63  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171552  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4682    89.64 
 
 
234 bp  244  2e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.727914  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0002  IS630 family transposase  91.62 
 
 
201 bp  236  5e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.657549  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0037  IS630 family transposase  93.83 
 
 
207 bp  234  2e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228515  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1267  IS630 family transposase  95 
 
 
168 bp  214  2e-53  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590086  normal  0.0269079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1297  hypothetical protein  88.41 
 
 
201 bp  167  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0042    92.55 
 
 
443 bp  131  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3657  IS630 family transposase  91.67 
 
 
99 bp  127  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3656  IS630 family transposase  86.18 
 
 
180 bp  109  7e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2800  transposase family protein  89.29 
 
 
848 bp  63.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4530    89.29 
 
 
2068 bp  63.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4531  transposase family protein  89.29 
 
 
848 bp  63.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0697  transposase family protein  89.29 
 
 
848 bp  63.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.294773  normal  0.913535 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1935  transposase family protein  89.29 
 
 
848 bp  63.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2885  transposase family protein  89.29 
 
 
848 bp  63.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.520201  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4000  transposase family protein  89.29 
 
 
848 bp  63.9  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.897046 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3653  hypothetical protein  85.96 
 
 
120 bp  50.1  0.0006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal  0.260401 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>