27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4046 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_4046    100 
 
 
589 bp  1168    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637068  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0026    88.66 
 
 
549 bp  509  9.999999999999999e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1373    87.6 
 
 
729 bp  492  1e-137  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3299    86.85 
 
 
773 bp  434  1e-119  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000302291  decreased coverage  0.00726041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3946    86.46 
 
 
486 bp  420  9.999999999999999e-116  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.384523  normal  0.0272745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3608    84.42 
 
 
635 bp  414  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1391    86.48 
 
 
455 bp  383  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0030    89.14 
 
 
302 bp  325  8e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171552  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4851    86.56 
 
 
351 bp  278  2.0000000000000002e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4682    94.94 
 
 
234 bp  274  2.9999999999999997e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.727914  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3615    85.71 
 
 
318 bp  256  6e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0926    87.1 
 
 
291 bp  252  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0003    85.02 
 
 
342 bp  252  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0002  IS630 family transposase  91.76 
 
 
201 bp  226  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.657549  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0860    83.58 
 
 
443 bp  226  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1297  hypothetical protein  90.42 
 
 
201 bp  196  5e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3176    83.84 
 
 
300 bp  139  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.195656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1267  IS630 family transposase  85.98 
 
 
168 bp  135  2.0000000000000002e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.590086  normal  0.0269079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3655    89.66 
 
 
327 bp  127  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3657  IS630 family transposase  94.81 
 
 
99 bp  121  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0037  IS630 family transposase  84.57 
 
 
207 bp  115  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228515  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0042    90.43 
 
 
443 bp  115  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3652  IS630 family transposase  85.29 
 
 
243 bp  111  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.267195 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3656  IS630 family transposase  83.53 
 
 
180 bp  107  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0004    88.75 
 
 
399 bp  79.8  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3651    96.77 
 
 
294 bp  54  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.263475 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0925  transposase  93.94 
 
 
294 bp  50.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>