23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_3655 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_3655    100 
 
 
327 bp  648    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3299    86.08 
 
 
773 bp  258  9e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000302291  decreased coverage  0.00726041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1373    84.33 
 
 
729 bp  220  2e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0004    85.89 
 
 
399 bp  200  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0861  transposase  91.95 
 
 
210 bp  200  2.0000000000000003e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.409125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3651    85.97 
 
 
294 bp  192  4e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.263475 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1392  transposase  93.7 
 
 
234 bp  188  7e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4850  IS630 family transposase  89.54 
 
 
153 bp  176  2.9999999999999996e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0925  transposase  85.58 
 
 
294 bp  174  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1256  transposase  85.45 
 
 
297 bp  172  4e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.369513  normal  0.0252492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0036    89.04 
 
 
216 bp  163  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137642  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4683  IS630 family transposase  89.47 
 
 
165 bp  153  4e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.831884  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4164  transposase  87.07 
 
 
210 bp  141  1e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312743  normal  0.735246 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0026    88.32 
 
 
549 bp  137  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3947  hypothetical protein  90 
 
 
150 bp  131  1.0000000000000001e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.936917  normal  0.0256055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3175  IS630 family transposase  89.38 
 
 
186 bp  129  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4046    89.66 
 
 
589 bp  127  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637068  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1266  hypothetical protein  88.75 
 
 
120 bp  87.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.964404  normal  0.0259834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0003    86.52 
 
 
342 bp  81.8  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0574  hypothetical protein  94.12 
 
 
114 bp  77.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1420  IS630 family transposase  89.55 
 
 
147 bp  77.8  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.990525  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0123    81.05 
 
 
192 bp  46.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19105  normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3608    79.53 
 
 
635 bp  46.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.331391 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>