14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0123 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0123    100 
 
 
192 bp  381  1e-104  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.19105  normal  0.109067 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1392  transposase  84.21 
 
 
234 bp  69.9  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3175  IS630 family transposase  86.96 
 
 
186 bp  65.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0036    83.16 
 
 
216 bp  61.9  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137642  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0861  transposase  83.16 
 
 
210 bp  61.9  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.409125 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0004    82.18 
 
 
399 bp  58  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1256  transposase  82.42 
 
 
297 bp  54  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.369513  normal  0.0252492 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4850  IS630 family transposase  82.11 
 
 
153 bp  54  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0925  transposase  81.91 
 
 
294 bp  52  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4683  IS630 family transposase  84.06 
 
 
165 bp  50.1  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.831884  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1266  hypothetical protein  90 
 
 
120 bp  48.1  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.964404  normal  0.0259834 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3651    81.32 
 
 
294 bp  46.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.263475 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3655    81.05 
 
 
327 bp  46.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4164  transposase  81.61 
 
 
210 bp  46.1  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.312743  normal  0.735246 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>