22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0926 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0926    100 
 
 
291 bp  577  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3946    93.23 
 
 
486 bp  369  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.384523  normal  0.0272745 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1391    92.09 
 
 
455 bp  369  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3608    90.68 
 
 
635 bp  339  2.9999999999999997e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.331391 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4851    91.98 
 
 
351 bp  337  1e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4682    91.3 
 
 
234 bp  274  1e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.727914  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3299    91.39 
 
 
773 bp  264  1e-68  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000302291  decreased coverage  0.00726041 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4046    87.1 
 
 
589 bp  252  5e-65  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.637068  normal  0.133593 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0002  IS630 family transposase  94.08 
 
 
201 bp  248  6.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.657549  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0030    86.81 
 
 
302 bp  238  7e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171552  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1297  hypothetical protein  90.36 
 
 
201 bp  186  2.0000000000000003e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3176    94.17 
 
 
300 bp  157  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.195656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1373    84.65 
 
 
729 bp  149  5e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0860    94.62 
 
 
443 bp  145  8e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.4286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0026    86.02 
 
 
549 bp  139  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3657  IS630 family transposase  92.78 
 
 
99 bp  129  5e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.139736 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0042    90.91 
 
 
443 bp  117  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3656  IS630 family transposase  93.33 
 
 
180 bp  109  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.138028 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3653  hypothetical protein  91.94 
 
 
120 bp  83.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.993781  normal  0.260401 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0037  IS630 family transposase  97.44 
 
 
207 bp  69.9  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.228515  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3615    86.11 
 
 
318 bp  63.9  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.140721 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0003    88.37 
 
 
342 bp  46.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.526656  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>