135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4711 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4711  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  429  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1234  ABC transport system permease protein  61.64 
 
 
246 aa  188  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000110652 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0659  hypothetical protein  56.89 
 
 
258 aa  181  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3011  hypothetical protein  42.63 
 
 
248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000384912 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0217  hypothetical protein  45.02 
 
 
250 aa  106  3e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0609104  hitchhiker  0.00507378 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0689  hypothetical protein  28.86 
 
 
257 aa  105  8e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.393246  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1173  hypothetical protein  52.52 
 
 
261 aa  105  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0721339  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0254  hypothetical protein  32.86 
 
 
251 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000359378  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4303  hypothetical protein  31.28 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.121514 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4241  hypothetical protein  31.28 
 
 
258 aa  93.6  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5084  hypothetical protein  29.41 
 
 
265 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5081  hypothetical protein  29.41 
 
 
265 aa  92.4  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5079  hypothetical protein  29.41 
 
 
265 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4811  hypothetical protein  28.96 
 
 
265 aa  92  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5176  hypothetical protein  28.96 
 
 
265 aa  92  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4760  hypothetical protein  29.41 
 
 
264 aa  91.7  9e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4653  hypothetical protein  28.96 
 
 
265 aa  91.3  1e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0161  hypothetical protein  29.41 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5050  hypothetical protein  28.96 
 
 
265 aa  91.3  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4673  hypothetical protein  28.96 
 
 
265 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2822  ABC transporter, inner membrane subunit  31.28 
 
 
262 aa  90.1  3e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.311883  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01854  hypothetical protein  28.97 
 
 
266 aa  89  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003828  ABC-type uncharacterized transport system permease component  33.79 
 
 
270 aa  86.3  4e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0426  hypothetical protein  26.82 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0279  hypothetical protein  30.92 
 
 
260 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0826  membrane protein  35.77 
 
 
263 aa  84.3  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.293934  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00442  predicted inner membrane protein  26.82 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3119  conserved hypothetical protein  26.82 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00447  hypothetical protein  26.82 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0570  hypothetical protein  26.82 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0530  hypothetical protein  26.82 
 
 
259 aa  83.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3125  hypothetical protein  26.82 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0540  hypothetical protein  26.82 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1804  hypothetical protein  31.46 
 
 
265 aa  83.2  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0595  hypothetical protein  26.82 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0552  hypothetical protein  26.39 
 
 
259 aa  82.4  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.417119  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0557  hypothetical protein  26.39 
 
 
259 aa  81.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0611  hypothetical protein  26.39 
 
 
259 aa  81.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0567  hypothetical protein  26.39 
 
 
259 aa  81.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0550  hypothetical protein  26.39 
 
 
259 aa  81.6  0.000000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2510  hypothetical protein  28.51 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0250  hypothetical protein  37.44 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0426  hypothetical protein  37.44 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.320554  hitchhiker  0.0000000053706 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2007  ABC-type transport system, permease component  31.92 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089276  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1627  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  31.33 
 
 
251 aa  80.1  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1685  hypothetical protein  31.43 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A09  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  30.9 
 
 
251 aa  79.3  0.00000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000000112109  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1171  hypothetical protein  26.03 
 
 
233 aa  79.3  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.937422 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2632  hypothetical protein  30.28 
 
 
261 aa  79.3  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0680234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1311  hypothetical protein  32.7 
 
 
272 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2321  hypothetical protein  32.7 
 
 
272 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1798  hypothetical protein  32.7 
 
 
272 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.539315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0097  hypothetical protein  32.7 
 
 
272 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2153  hypothetical protein  32.7 
 
 
272 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2190  hypothetical protein  32.7 
 
 
272 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1069  hypothetical protein  32.7 
 
 
272 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.443958  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2942  hypothetical protein  29.18 
 
 
256 aa  79  0.00000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0934  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  28.29 
 
 
253 aa  78.6  0.00000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000794066  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3829  putative ABC transport system permease protein  30.88 
 
 
263 aa  78.6  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000396404 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1713  hypothetical protein  31.63 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2456  hypothetical protein  37.69 
 
 
261 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1497  hypothetical protein  33.18 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0286332 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2266  hypothetical protein  31.75 
 
 
272 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336185  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1378  hypothetical protein  30.43 
 
 
242 aa  76.6  0.0000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0154277  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0731  hypothetical protein  29.06 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5072  putative ABC transporter, inner membrane subunit  31.43 
 
 
267 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362537  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6305  hypothetical protein  31.43 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1774  hypothetical protein  31.43 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.113625  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4666  hypothetical protein  25 
 
 
257 aa  75.9  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1799  hypothetical protein  31.43 
 
 
267 aa  75.9  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0630  hypothetical protein  36.04 
 
 
270 aa  75.1  0.0000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0731  hypothetical protein  29.3 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000207096  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0755  hypothetical protein  29.3 
 
 
262 aa  74.7  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000302353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1348  hypothetical protein  34.53 
 
 
264 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2859  hypothetical protein  36.89 
 
 
252 aa  73.6  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1176  hypothetical protein  21.92 
 
 
234 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3518  hypothetical protein  29.26 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000832658  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1466  hypothetical protein  27 
 
 
243 aa  73.6  0.000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000189703  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1466  hypothetical protein  33.18 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3461  hypothetical protein  28.78 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1087  hypothetical protein  27.35 
 
 
263 aa  73.6  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0986  hypothetical protein  33.03 
 
 
268 aa  72  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1504  hypothetical protein  24.31 
 
 
247 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0779  hypothetical protein  25.23 
 
 
247 aa  71.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.683136  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1073  hypothetical protein  30.14 
 
 
263 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.780627  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1863  hypothetical protein  32.54 
 
 
268 aa  68.9  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00500964  normal  0.0941942 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1807  hypothetical protein  35.82 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162766  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0534  hypothetical protein  32.54 
 
 
267 aa  68.6  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2037  hypothetical protein  30.61 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.179883  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2323  ABC transporter, inner membrane subunit  31.22 
 
 
268 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1234  hypothetical protein  27.98 
 
 
261 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0900  hypothetical protein  29.5 
 
 
258 aa  67  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1218  hypothetical protein  35.92 
 
 
258 aa  66.6  0.0000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0764  hypothetical protein  34.62 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0571603 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1139  hypothetical protein  24.22 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.529413 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1171  hypothetical protein  31.05 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.739375  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0698  hypothetical protein  31.82 
 
 
269 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.217447 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2020  hypothetical protein  27.73 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1727  hypothetical protein  28.21 
 
 
265 aa  65.1  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3633  hypothetical protein  32.04 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>