134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0217 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0217  hypothetical protein  100 
 
 		 250 aa  444  1.0000000000000001e-124  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0609104  hitchhiker  0.00507378 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4711  hypothetical protein  43 
 
 		 241 aa  115  6e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0659  hypothetical protein  45.37 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3011  hypothetical protein  40.19 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000384912 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1234  ABC transport system permease protein  42.16 
 
 		 246 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000110652 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1173  hypothetical protein  51.03 
 
 		 261 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0721339  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2822  ABC transporter, inner membrane subunit  31.94 
 
 		 262 aa  97.8  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.311883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0254  hypothetical protein  27.31 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000359378  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1466  hypothetical protein  25.21 
 
 		 243 aa  94.4  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000189703  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0689  hypothetical protein  28.43 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.393246  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00442  predicted inner membrane protein  28.1 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3119  conserved hypothetical protein  28.1 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00447  hypothetical protein  28.1 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0570  hypothetical protein  28.1 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0530  hypothetical protein  28.1 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3125  hypothetical protein  28.1 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000101868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0540  hypothetical protein  28.1 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0595  hypothetical protein  28.1 
 
 		 259 aa  93.6  3e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4666  hypothetical protein  29.21 
 
 		 257 aa  92.8  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0426  hypothetical protein  28.1 
 
 		 259 aa  93.2  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1466  hypothetical protein  31.75 
 
 		 274 aa  92  8e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0279  hypothetical protein  27.9 
 
 		 260 aa  91.3  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4303  hypothetical protein  29.86 
 
 		 258 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.121514 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1176  hypothetical protein  23.63 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4241  hypothetical protein  29.86 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0557  hypothetical protein  26.91 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0611  hypothetical protein  26.91 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0567  hypothetical protein  26.91 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0550  hypothetical protein  26.91 
 
 		 259 aa  89.7  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0934  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  28.14 
 
 		 253 aa  88.2  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000794066  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1504  hypothetical protein  24.23 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0552  hypothetical protein  26.51 
 
 		 259 aa  88.2  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.417119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2510  hypothetical protein  28.97 
 
 		 258 aa  85.5  6e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1171  hypothetical protein  24.26 
 
 		 233 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.937422 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0779  hypothetical protein  24.67 
 
 		 247 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.683136  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01854  hypothetical protein  28.95 
 
 		 266 aa  83.6  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1627  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.73 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A09  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.73 
 
 		 251 aa  81.6  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000000112109  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2859  hypothetical protein  30.22 
 
 		 252 aa  81.3  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1087  hypothetical protein  26.12 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5050  hypothetical protein  27.73 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4811  hypothetical protein  26.69 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4653  hypothetical protein  27.73 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5176  hypothetical protein  26.69 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5079  hypothetical protein  26.69 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4673  hypothetical protein  26.69 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5081  hypothetical protein  26.69 
 
 		 265 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5084  hypothetical protein  26.92 
 
 		 265 aa  79.3  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0161  hypothetical protein  26.92 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2037  hypothetical protein  28.72 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.179883  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0731  hypothetical protein  28.07 
 
 		 271 aa  78.6  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.146509 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4760  hypothetical protein  27.31 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2480  hypothetical protein  29.23 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00188976  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2529  hypothetical protein  29.23 
 
 		 258 aa  77.8  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00951113  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2456  hypothetical protein  30.23 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3829  putative ABC transport system permease protein  28.11 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000396404 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1218  hypothetical protein  32.28 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1804  hypothetical protein  28.88 
 
 		 265 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0900  hypothetical protein  33.08 
 
 		 258 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3518  hypothetical protein  33.59 
 
 		 257 aa  73.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000832658  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1727  hypothetical protein  28.02 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0700  hypothetical protein  38.26 
 
 		 264 aa  72.8  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0630  hypothetical protein  27.04 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2942  hypothetical protein  30.58 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0731  hypothetical protein  26.61 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000207096  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0755  hypothetical protein  26.61 
 
 		 262 aa  72.4  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000302353  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0826  membrane protein  24.77 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.293934  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003828  ABC-type uncharacterized transport system permease component  27.95 
 
 		 270 aa  72  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1171  hypothetical protein  31.7 
 
 		 261 aa  72  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.739375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2007  ABC-type transport system, permease component  30.77 
 
 		 266 aa  72  0.000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089276  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1378  hypothetical protein  28.3 
 
 		 242 aa  71.6  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0154277  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND04990  conserved hypothetical protein  27.93 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.804578  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1097  hypothetical protein  24.88 
 
 		 257 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215237  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1835  hypothetical protein  31.68 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1348  hypothetical protein  24.23 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1073  hypothetical protein  29.36 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.780627  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0767  hypothetical protein  32.94 
 
 		 263 aa  68.6  0.00000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15630  conserved hypothetical protein TIGR00245  25.32 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2632  hypothetical protein  26.75 
 
 		 261 aa  67.8  0.0000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0680234  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1139  hypothetical protein  23.41 
 
 		 265 aa  66.2  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.529413 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1309  hypothetical protein  27.85 
 
 		 259 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2266  hypothetical protein  29.78 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336185  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1311  hypothetical protein  29.15 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2321  hypothetical protein  29.15 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0764  hypothetical protein  32.09 
 
 		 269 aa  63.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0571603 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2539  hypothetical protein  29.19 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0939059  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1713  hypothetical protein  28.12 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1798  hypothetical protein  29.15 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.539315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0097  hypothetical protein  29.15 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2153  hypothetical protein  29.15 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2190  hypothetical protein  29.15 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1069  hypothetical protein  29.15 
 
 		 272 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.443958  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1685  hypothetical protein  28.76 
 
 		 267 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1058  hypothetical protein  26.39 
 
 		 261 aa  62.8  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3633  hypothetical protein  28.69 
 
 		 265 aa  62.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1497  hypothetical protein  28.99 
 
 		 267 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0286332 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0698  hypothetical protein  33.07 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.217447 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0169  ABC transporter, permease protein, putative  27.7 
 
 		 263 aa  62.4  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.645871  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6305  hypothetical protein  28.57 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1774  hypothetical protein  28.57 
 
 		 267 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.113625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>