135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0426 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011761  AFE_0250  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0426  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.320554  hitchhiker  0.0000000053706 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0254  hypothetical protein  35.65 
 
 
251 aa  165  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000359378  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0689  hypothetical protein  36.12 
 
 
257 aa  150  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.393246  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1466  hypothetical protein  40.78 
 
 
243 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000189703  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A09  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  38.03 
 
 
251 aa  142  4e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000000112109  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1627  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  37.34 
 
 
251 aa  138  7.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00442  predicted inner membrane protein  35.78 
 
 
259 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3119  conserved hypothetical protein  35.78 
 
 
259 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00447  hypothetical protein  35.78 
 
 
259 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0570  hypothetical protein  35.78 
 
 
259 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3125  hypothetical protein  35.78 
 
 
259 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000101868 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0540  hypothetical protein  35.78 
 
 
259 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0426  hypothetical protein  35.34 
 
 
259 aa  137  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0595  hypothetical protein  35.78 
 
 
259 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.531992 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0530  hypothetical protein  35.34 
 
 
259 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4666  hypothetical protein  36.91 
 
 
257 aa  136  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2859  hypothetical protein  34.48 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0552  hypothetical protein  35.62 
 
 
259 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.417119  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0557  hypothetical protein  35.62 
 
 
259 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.711318  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0611  hypothetical protein  35.62 
 
 
259 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0567  hypothetical protein  35.62 
 
 
259 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0550  hypothetical protein  35.62 
 
 
259 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1466  hypothetical protein  33.61 
 
 
274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3461  hypothetical protein  31.88 
 
 
262 aa  123  3e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2510  hypothetical protein  33.64 
 
 
258 aa  123  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.441683 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2037  hypothetical protein  32.86 
 
 
258 aa  121  9e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.179883  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1804  hypothetical protein  34.86 
 
 
265 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1073  hypothetical protein  31.67 
 
 
263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.780627  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1234  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  119  4.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1176  hypothetical protein  31.34 
 
 
234 aa  119  7e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2632  hypothetical protein  37.26 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0680234  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2480  hypothetical protein  31.19 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00188976  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2529  hypothetical protein  31.19 
 
 
258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00951113  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1171  hypothetical protein  32.41 
 
 
233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.937422 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2456  hypothetical protein  34.45 
 
 
261 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.920559  normal  0.509679 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1504  hypothetical protein  32.87 
 
 
247 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2323  ABC transporter, inner membrane subunit  32.77 
 
 
268 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0934  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  29.67 
 
 
253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000794066  normal  0.313327 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0279  hypothetical protein  32.71 
 
 
260 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1058  hypothetical protein  30.09 
 
 
261 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1309  hypothetical protein  34.23 
 
 
259 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0779  hypothetical protein  34.72 
 
 
247 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.683136  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0698  hypothetical protein  33.73 
 
 
269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.645754  normal  0.217447 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0080  ABC transporter permease  34.21 
 
 
266 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1727  hypothetical protein  32.1 
 
 
265 aa  113  3e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1863  hypothetical protein  30.54 
 
 
268 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00500964  normal  0.0941942 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0767  hypothetical protein  34.83 
 
 
263 aa  112  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1311  hypothetical protein  32.93 
 
 
272 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2321  hypothetical protein  32.93 
 
 
272 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2266  hypothetical protein  32.52 
 
 
272 aa  112  6e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.336185  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1798  hypothetical protein  32.93 
 
 
272 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.539315  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0097  hypothetical protein  32.93 
 
 
272 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.401085  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2153  hypothetical protein  32.93 
 
 
272 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2190  hypothetical protein  32.93 
 
 
272 aa  112  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1069  hypothetical protein  32.93 
 
 
272 aa  112  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.443958  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1348  hypothetical protein  32.54 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4303  hypothetical protein  32.44 
 
 
258 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.121514 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1171  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.739375  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0076  hypothetical protein  32.93 
 
 
269 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0298659  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1807  hypothetical protein  33.67 
 
 
265 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162766  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4241  hypothetical protein  32 
 
 
258 aa  110  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0986  hypothetical protein  30.08 
 
 
268 aa  108  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1087  hypothetical protein  31.46 
 
 
263 aa  108  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0764  hypothetical protein  33.98 
 
 
269 aa  108  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0571603 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0169  ABC transporter, permease protein, putative  30.74 
 
 
263 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.645871  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2539  hypothetical protein  33.04 
 
 
266 aa  108  8.000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0939059  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1713  hypothetical protein  34.33 
 
 
267 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0900  hypothetical protein  32.89 
 
 
258 aa  107  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0342304 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3518  hypothetical protein  30.47 
 
 
257 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.000832658  normal  0.16619 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0534  hypothetical protein  33.84 
 
 
267 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1685  hypothetical protein  34.51 
 
 
267 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2822  ABC transporter, inner membrane subunit  33.77 
 
 
262 aa  105  9e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.311883  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6305  hypothetical protein  32.24 
 
 
267 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1774  hypothetical protein  32.24 
 
 
267 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.113625  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1497  hypothetical protein  34.69 
 
 
267 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0286332 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1799  hypothetical protein  32.24 
 
 
267 aa  104  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.551052 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1218  hypothetical protein  29.3 
 
 
258 aa  104  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5072  putative ABC transporter, inner membrane subunit  31.56 
 
 
267 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.362537  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0198  hypothetical protein  28.69 
 
 
268 aa  103  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.68555 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2007  ABC-type transport system, permease component  32.48 
 
 
266 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00089276  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1378  hypothetical protein  30.05 
 
 
242 aa  100  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0154277  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3633  hypothetical protein  30.7 
 
 
265 aa  99  7e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15630  conserved hypothetical protein TIGR00245  29.3 
 
 
260 aa  97.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003828  ABC-type uncharacterized transport system permease component  30.74 
 
 
270 aa  97.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1139  hypothetical protein  27.93 
 
 
265 aa  96.7  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.529413 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0748  hypothetical protein  33.09 
 
 
272 aa  96.7  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3122  hypothetical protein  28.4 
 
 
268 aa  95.9  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.859294  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2104  hypothetical protein  29.22 
 
 
267 aa  95.1  9e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.399014  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1097  hypothetical protein  26.44 
 
 
257 aa  95.1  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.215237  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2410  hypothetical protein  29.83 
 
 
265 aa  95.1  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2290  hypothetical protein  29.67 
 
 
261 aa  94.4  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000247425 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1437  hypothetical protein  31.22 
 
 
264 aa  92.8  4e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.318799  normal  0.0549134 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0659  hypothetical protein  33.53 
 
 
258 aa  93.2  4e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0731  hypothetical protein  29.03 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000207096  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0755  hypothetical protein  29.03 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000302353  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2020  hypothetical protein  29.25 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7995  hypothetical protein  32.56 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.138428  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01854  hypothetical protein  28.22 
 
 
266 aa  91.7  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2239  hypothetical protein  32.56 
 
 
263 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.255232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>