62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2960 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2960  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 		 354 aa  687    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0697237  normal  0.577933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8353  hypothetical protein  60.83 
 
 		 366 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0939  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.82 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211374  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1768  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.76 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3787  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  42.9 
 
 		 426 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499391  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3735  hypothetical protein  34.18 
 
 		 350 aa  129  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4116  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.38 
 
 		 350 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  normal  0.872293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4227  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  41.56 
 
 		 390 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07610  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  33.99 
 
 		 330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.681594  normal  0.51136 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2892  hypothetical protein  31.99 
 
 		 440 aa  109  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.001501  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2467  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.75 
 
 		 497 aa  97.4  3e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7937  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  40.12 
 
 		 419 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1593  hypothetical protein  36.21 
 
 		 361 aa  91.7  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0789  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.05 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.46 
 
 		 368 aa  90.9  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1811  hypothetical protein  41.01 
 
 		 273 aa  82.8  0.000000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76479  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13216  hypothetical protein  37.14 
 
 		 299 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.35418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4657  hypothetical protein  32.68 
 
 		 283 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27530  hypothetical protein  34.77 
 
 		 287 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3041  hypothetical protein  34.69 
 
 		 298 aa  71.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0466154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4125  hypothetical protein  27.43 
 
 		 290 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1519  hypothetical protein  41.03 
 
 		 249 aa  70.5  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1430  hypothetical protein  33.8 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1466  hypothetical protein  33.8 
 
 		 280 aa  69.3  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1412  hypothetical protein  33.8 
 
 		 280 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3491  hypothetical protein  34.03 
 
 		 306 aa  67  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0618113  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1183  hypothetical protein  38.51 
 
 		 275 aa  63.9  0.000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2507  ThiF family protein  25.75 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.720809 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30 
 
 		 372 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.628178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0955  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.11 
 
 		 355 aa  55.1  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000516657  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3926  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23.77 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.396526  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4371  HesA/MoeB/ThiF family protein  24.5 
 
 		 367 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.89161e-22 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1624  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23.75 
 
 		 371 aa  50.4  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.100151  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19120  hypothetical protein  28.68 
 
 		 336 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.093214 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2183  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  30.67 
 
 		 245 aa  48.9  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1265  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.06 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3121  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.3 
 
 		 604 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1372  hypothetical protein  22.81 
 
 		 589 aa  48.1  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.438786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  27.93 
 
 		 247 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.3 
 
 		 604 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0525  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.77 
 
 		 248 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.449442 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0383  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.83 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2982  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.08 
 
 		 392 aa  47  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.379913 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0454  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  34.59 
 
 		 393 aa  47  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427252  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1246  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.1 
 
 		 371 aa  47  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000103579  normal  0.557515 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8385  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  35.78 
 
 		 393 aa  47  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0620  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  26.14 
 
 		 339 aa  46.6  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1499  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.13 
 
 		 250 aa  46.6  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.039426  normal  0.0112948 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0649  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  24.24 
 
 		 339 aa  45.4  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.674044  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1667  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.42 
 
 		 598 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1439  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.4 
 
 		 239 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2929  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.86 
 
 		 604 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.94961  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  29.47 
 
 		 396 aa  44.3  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1344  UBA/THIF-type NAD/FAD-binding protein  27.06 
 
 		 260 aa  43.9  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17561  molybdopterin biosynthesis protein  24.69 
 
 		 382 aa  43.9  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4744  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.96 
 
 		 263 aa  43.1  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.697627  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6934  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.15 
 
 		 596 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1822  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.85 
 
 		 256 aa  43.1  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0657406  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4541  thiamine/molybdopterin biosynthesis ThiF/MoeB-like protein  23.32 
 
 		 339 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.43862 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  33.33 
 
 		 390 aa  42.7  0.009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1858  thiF protein, putative  35.11 
 
 		 250 aa  42.7  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2127  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.61 
 
 		 258 aa  42.7  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>