32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2892 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2892  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  832    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.001501  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2467  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.57 
 
 		 497 aa  208  2e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0789  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.83 
 
 		 391 aa  145  1e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1768  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.28 
 
 		 392 aa  142  1.9999999999999998e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0939  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.98 
 
 		 399 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211374  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4227  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  41.15 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3735  hypothetical protein  34.32 
 
 		 350 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1593  hypothetical protein  37.12 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27530  hypothetical protein  37.31 
 
 		 287 aa  105  1e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4116  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.75 
 
 		 350 aa  103  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  normal  0.872293 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2960  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.99 
 
 		 354 aa  99.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0697237  normal  0.577933 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1183  hypothetical protein  36.99 
 
 		 275 aa  99.4  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7937  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  40 
 
 		 419 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8353  hypothetical protein  31.58 
 
 		 366 aa  94.4  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07610  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  35.82 
 
 		 330 aa  94  5e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.681594  normal  0.51136 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3787  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.86 
 
 		 426 aa  90.5  6e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499391  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.87 
 
 		 368 aa  84.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1519  hypothetical protein  42.54 
 
 		 249 aa  80.5  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4657  hypothetical protein  36.14 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1811  hypothetical protein  37.5 
 
 		 273 aa  77.4  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76479  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1466  hypothetical protein  39.44 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13216  hypothetical protein  40 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.35418 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1430  hypothetical protein  38.73 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1412  hypothetical protein  38.73 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4125  hypothetical protein  28.05 
 
 		 290 aa  70.1  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3491  hypothetical protein  33.33 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0618113  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3041  hypothetical protein  50.91 
 
 		 298 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0466154  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2183  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.77 
 
 		 245 aa  48.9  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0719  hypothetical protein  29.88 
 
 		 333 aa  47.4  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0955  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.65 
 
 		 355 aa  43.5  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000516657  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2507  ThiF family protein  23.11 
 
 		 338 aa  43.5  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.720809 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19120  hypothetical protein  23.68 
 
 		 336 aa  43.1  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.093214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>