28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7937 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_7937  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 		 419 aa  821    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8353  hypothetical protein  36.66 
 
 		 366 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0939  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.89 
 
 		 399 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211374  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1768  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.84 
 
 		 392 aa  160  3e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2960  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.59 
 
 		 354 aa  157  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0697237  normal  0.577933 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3787  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  36.44 
 
 		 426 aa  157  4e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499391  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2892  hypothetical protein  30.5 
 
 		 440 aa  118  1.9999999999999998e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.001501  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4116  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.42 
 
 		 350 aa  97.1  5e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  normal  0.872293 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0789  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.98 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3735  hypothetical protein  28.61 
 
 		 350 aa  91.3  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4227  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  34.91 
 
 		 390 aa  91.3  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2467  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.1 
 
 		 497 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07610  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  29.15 
 
 		 330 aa  86.7  7e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.681594  normal  0.51136 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1811  hypothetical protein  37.43 
 
 		 273 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76479  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1183  hypothetical protein  38.57 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1593  hypothetical protein  31.35 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13216  hypothetical protein  36.11 
 
 		 299 aa  72  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.35418 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.5 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4657  hypothetical protein  30.95 
 
 		 283 aa  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1412  hypothetical protein  43.06 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1466  hypothetical protein  43.06 
 
 		 280 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1430  hypothetical protein  43.06 
 
 		 280 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3491  hypothetical protein  29.3 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0618113  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27530  hypothetical protein  26.17 
 
 		 287 aa  57.8  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1519  hypothetical protein  36.07 
 
 		 249 aa  56.6  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3041  hypothetical protein  57.14 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0466154  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4125  hypothetical protein  30.17 
 
 		 290 aa  47  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3925  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  23.57 
 
 		 377 aa  43.1  0.008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.384403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>