41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2467 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2467  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
497 aa  922    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2892  hypothetical protein  41.04 
 
 
440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.001501  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0789  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.61 
 
 
391 aa  176  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1768  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.49 
 
 
392 aa  139  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4227  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  41.52 
 
 
390 aa  114  5e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0939  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.98 
 
 
399 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211374  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1593  hypothetical protein  39.15 
 
 
361 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8353  hypothetical protein  32.89 
 
 
366 aa  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1183  hypothetical protein  39.51 
 
 
275 aa  103  5e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27530  hypothetical protein  36.14 
 
 
287 aa  98.2  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2960  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.75 
 
 
354 aa  96.7  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0697237  normal  0.577933 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07610  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  30.81 
 
 
330 aa  92  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.681594  normal  0.51136 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3735  hypothetical protein  32.16 
 
 
350 aa  92.4  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216223  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3787  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  34.42 
 
 
426 aa  91.3  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499391  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1811  hypothetical protein  39.57 
 
 
273 aa  80.9  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76479  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4116  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.29 
 
 
350 aa  80.5  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  normal  0.872293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7937  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  26.96 
 
 
419 aa  77.4  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13216  hypothetical protein  38.03 
 
 
299 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.35418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4657  hypothetical protein  36.05 
 
 
283 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111613  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4125  hypothetical protein  27.74 
 
 
290 aa  71.2  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.81 
 
 
368 aa  66.6  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3041  hypothetical protein  57.14 
 
 
298 aa  65.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0466154  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3491  hypothetical protein  35.56 
 
 
306 aa  62.4  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0618113  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1412  hypothetical protein  36.42 
 
 
280 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1430  hypothetical protein  36.42 
 
 
280 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1466  hypothetical protein  36.42 
 
 
280 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1519  hypothetical protein  34.57 
 
 
249 aa  60.5  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0719  hypothetical protein  28.37 
 
 
333 aa  60.1  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2548  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  30.77 
 
 
252 aa  58.9  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0955  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.03 
 
 
355 aa  58.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000516657  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1439  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.12 
 
 
239 aa  50.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2507  ThiF family protein  23.93 
 
 
338 aa  49.7  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.720809 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2453  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  27.63 
 
 
253 aa  46.2  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1000  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.93 
 
 
247 aa  46.6  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3926  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  22.75 
 
 
364 aa  45.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.396526  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  26.43 
 
 
392 aa  45.8  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2522  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  27.54 
 
 
249 aa  46.2  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0178  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.5 
 
 
243 aa  45.1  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2816  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  27.12 
 
 
249 aa  45.1  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.100308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2855  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  25.97 
 
 
248 aa  44.7  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000693391  hitchhiker  0.000000536113 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.82 
 
 
396 aa  43.9  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>