30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0935 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 		 368 aa  686    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07610  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  42.51 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.681594  normal  0.51136 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0939  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.4 
 
 		 399 aa  135  8e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211374  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3787  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  37.89 
 
 		 426 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499391  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3491  hypothetical protein  31.3 
 
 		 306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0618113  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3735  hypothetical protein  36.94 
 
 		 350 aa  109  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4227  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  35.33 
 
 		 390 aa  105  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2892  hypothetical protein  33.33 
 
 		 440 aa  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.001501  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2960  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.51 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0697237  normal  0.577933 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13216  hypothetical protein  42.86 
 
 		 299 aa  95.9  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.35418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4657  hypothetical protein  32.13 
 
 		 283 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8353  hypothetical protein  35.93 
 
 		 366 aa  93.6  5e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1768  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.53 
 
 		 392 aa  93.6  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4116  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.63 
 
 		 350 aa  92.8  8e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  normal  0.872293 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0789  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.72 
 
 		 391 aa  90.9  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1811  hypothetical protein  40 
 
 		 273 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76479  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1593  hypothetical protein  35.47 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1466  hypothetical protein  51.11 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1430  hypothetical protein  51.11 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1412  hypothetical protein  51.11 
 
 		 280 aa  80.9  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2467  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.8 
 
 		 497 aa  75.1  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7937  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  35.76 
 
 		 419 aa  74.3  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4125  hypothetical protein  29.25 
 
 		 290 aa  62.8  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1183  hypothetical protein  34.16 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27530  hypothetical protein  37.18 
 
 		 287 aa  58.2  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3041  hypothetical protein  42.19 
 
 		 298 aa  54.7  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0466154  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0955  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.97 
 
 		 355 aa  50.4  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000516657  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1519  hypothetical protein  30.65 
 
 		 249 aa  46.6  0.0007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.38 
 
 		 244 aa  46.2  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2122  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.62 
 
 		 247 aa  45.1  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0389221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>