73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1768 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1768  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
392 aa  740    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3787  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  47.68 
 
 
426 aa  199  7.999999999999999e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499391  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0939  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.48 
 
 
399 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211374  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8353  hypothetical protein  41.76 
 
 
366 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2960  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.76 
 
 
354 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0697237  normal  0.577933 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3735  hypothetical protein  38.35 
 
 
350 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216223  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4116  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.22 
 
 
350 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  normal  0.872293 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2892  hypothetical protein  35.28 
 
 
440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.001501  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2467  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.39 
 
 
497 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4227  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  39.94 
 
 
390 aa  133  6.999999999999999e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0789  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.36 
 
 
391 aa  120  6e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7937  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  44.38 
 
 
419 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1593  hypothetical protein  36.61 
 
 
361 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07610  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  32.66 
 
 
330 aa  99.4  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.681594  normal  0.51136 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1183  hypothetical protein  36.24 
 
 
275 aa  92.4  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.37 
 
 
368 aa  85.1  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4125  hypothetical protein  29.88 
 
 
290 aa  82  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1519  hypothetical protein  40.98 
 
 
249 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1811  hypothetical protein  43.48 
 
 
273 aa  77  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76479  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27530  hypothetical protein  32.51 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3491  hypothetical protein  35.37 
 
 
306 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0618113  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3041  hypothetical protein  38.69 
 
 
298 aa  67.4  0.0000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0466154  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4657  hypothetical protein  37.7 
 
 
283 aa  67  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111613  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2507  ThiF family protein  26.52 
 
 
338 aa  66.6  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.720809 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.42 
 
 
372 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.628178  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1466  hypothetical protein  38.58 
 
 
280 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13216  hypothetical protein  38.14 
 
 
299 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.35418 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1412  hypothetical protein  37.8 
 
 
280 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1430  hypothetical protein  37.8 
 
 
280 aa  61.6  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0955  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.14 
 
 
355 aa  60.5  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000516657  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3926  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  20.16 
 
 
364 aa  57.4  0.0000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.396526  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  26.06 
 
 
247 aa  56.2  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1540  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  34.38 
 
 
230 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.207778  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2929  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.68 
 
 
604 aa  51.2  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.94961  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2415  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.12 
 
 
230 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.124051  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2548  molybdopterin synthase sulfurylase MoeB  25 
 
 
252 aa  50.4  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2264  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.64 
 
 
258 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.927293  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0188  hypothetical protein  25.83 
 
 
252 aa  48.9  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430925  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3121  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.68 
 
 
604 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  22.94 
 
 
269 aa  48.9  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0170878  normal  0.53538 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1970  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  24.68 
 
 
269 aa  48.5  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014844  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.68 
 
 
604 aa  48.5  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54676  Ubiquitin--protein ligase molybdopterin-converting factor  32.04 
 
 
437 aa  48.1  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  36.49 
 
 
257 aa  48.1  0.0003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  24.69 
 
 
395 aa  47.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2327  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.5 
 
 
230 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.564205  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1667  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.36 
 
 
598 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.767649  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1350  thiF family protein  24.78 
 
 
264 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1940  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.4 
 
 
356 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.124053  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0599  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  20.83 
 
 
354 aa  47  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1138  thiamine biosynthesis protein ThiF  38.16 
 
 
213 aa  47  0.0007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.119618 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  24.54 
 
 
389 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1945  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44 
 
 
350 aa  46.2  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0410103  decreased coverage  0.00836902 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2273  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.25 
 
 
232 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0993355 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2855  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  28.39 
 
 
248 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000693391  hitchhiker  0.000000536113 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00932  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.17 
 
 
379 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1822  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.83 
 
 
256 aa  45.4  0.001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0657406  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06090  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.17 
 
 
379 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0134  ThiF family protein  35.8 
 
 
594 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1620  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.52 
 
 
266 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.407651 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1261  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.69 
 
 
246 aa  44.3  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1008  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.79 
 
 
244 aa  43.9  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0106797  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0728  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.14 
 
 
247 aa  44.3  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0722  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.34 
 
 
300 aa  44.3  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2005  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.87 
 
 
249 aa  43.9  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0792  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.34 
 
 
300 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.84 
 
 
253 aa  43.9  0.005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0037  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.98 
 
 
320 aa  43.9  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.86 
 
 
377 aa  43.9  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.03 
 
 
706 aa  43.5  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00326971  normal  0.0839405 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1314  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.67 
 
 
231 aa  43.5  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.530207  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1769  hypothetical protein  28.44 
 
 
423 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.549048  normal  0.774559 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  22.05 
 
 
386 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>