28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1593 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1593  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  699    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4227  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  35.47 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2892  hypothetical protein  35.42 
 
 
440 aa  111  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.001501  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2467  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35 
 
 
497 aa  108  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0939  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.1 
 
 
399 aa  102  7e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211374  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3735  hypothetical protein  33.93 
 
 
350 aa  94  4e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216223  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1768  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.07 
 
 
392 aa  93.2  6e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1183  hypothetical protein  31.61 
 
 
275 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2960  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.98 
 
 
354 aa  90.1  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0697237  normal  0.577933 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07610  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  30.77 
 
 
330 aa  89  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.681594  normal  0.51136 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4116  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.74 
 
 
350 aa  87  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  normal  0.872293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8353  hypothetical protein  33.91 
 
 
366 aa  84  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1811  hypothetical protein  35.64 
 
 
273 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76479  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4657  hypothetical protein  27.35 
 
 
283 aa  81.3  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111613  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13216  hypothetical protein  34.08 
 
 
299 aa  75.9  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.35418 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7937  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  31.35 
 
 
419 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4125  hypothetical protein  31.27 
 
 
290 aa  75.1  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0789  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  39.85 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3491  hypothetical protein  34.25 
 
 
306 aa  71.6  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0618113  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3041  hypothetical protein  46.67 
 
 
298 aa  68.9  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0466154  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.76 
 
 
368 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1466  hypothetical protein  27.09 
 
 
280 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1430  hypothetical protein  27.09 
 
 
280 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1412  hypothetical protein  27.09 
 
 
280 aa  62  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1519  hypothetical protein  38.74 
 
 
249 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3787  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.59 
 
 
426 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499391  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27530  hypothetical protein  29.09 
 
 
287 aa  53.5  0.000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0719  hypothetical protein  25.62 
 
 
333 aa  44.3  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>