41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8353 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8353  hypothetical protein  100 
 
 		 366 aa  706    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2960  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  60.83 
 
 		 354 aa  386  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0697237  normal  0.577933 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1768  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.76 
 
 		 392 aa  202  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7937  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  36.91 
 
 		 419 aa  182  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0939  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  38.58 
 
 		 399 aa  176  7e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211374  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3735  hypothetical protein  38.59 
 
 		 350 aa  155  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3787  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  41.46 
 
 		 426 aa  150  4e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499391  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4116  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.82 
 
 		 350 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  normal  0.872293 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2467  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.86 
 
 		 497 aa  113  5e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07610  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  33.33 
 
 		 330 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.681594  normal  0.51136 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2892  hypothetical protein  31.58 
 
 		 440 aa  110  4.0000000000000004e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.001501  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4227  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  38.53 
 
 		 390 aa  102  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1593  hypothetical protein  33.91 
 
 		 361 aa  96.3  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0789  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.73 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4125  hypothetical protein  28.77 
 
 		 290 aa  88.6  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.15 
 
 		 368 aa  83.2  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13216  hypothetical protein  34 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.35418 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4657  hypothetical protein  32.64 
 
 		 283 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1519  hypothetical protein  39.09 
 
 		 249 aa  72.4  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1430  hypothetical protein  34.97 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1811  hypothetical protein  36.73 
 
 		 273 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76479  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1412  hypothetical protein  34.97 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1466  hypothetical protein  34.97 
 
 		 280 aa  70.5  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1183  hypothetical protein  34.96 
 
 		 275 aa  69.3  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3491  hypothetical protein  34.72 
 
 		 306 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0618113  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3041  hypothetical protein  53.23 
 
 		 298 aa  67  0.0000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0466154  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27530  hypothetical protein  29.92 
 
 		 287 aa  63.2  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3926  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  19.57 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.396526  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0719  hypothetical protein  28.45 
 
 		 333 aa  53.5  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.34 
 
 		 372 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.628178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2183  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  27.92 
 
 		 245 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  24.6 
 
 		 247 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5993  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.79 
 
 		 586 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2477  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.2 
 
 		 338 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.509569 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1624  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  22.64 
 
 		 371 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.100151  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2507  ThiF family protein  24.26 
 
 		 338 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.720809 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.32 
 
 		 244 aa  43.9  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3463  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.45 
 
 		 379 aa  43.5  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.838901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3121  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.92 
 
 		 604 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1246  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.03 
 
 		 371 aa  43.5  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000103579  normal  0.557515 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.92 
 
 		 604 aa  43.5  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>