27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3041 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3041  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  576  1.0000000000000001e-163  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0466154  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1811  hypothetical protein  40.07 
 
 		 273 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76479  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4657  hypothetical protein  39.52 
 
 		 283 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13216  hypothetical protein  35.93 
 
 		 299 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.35418 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3491  hypothetical protein  35.54 
 
 		 306 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0618113  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1466  hypothetical protein  35.76 
 
 		 280 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1412  hypothetical protein  35.42 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1430  hypothetical protein  35.42 
 
 		 280 aa  126  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07610  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  39.16 
 
 		 330 aa  93.6  3e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.681594  normal  0.51136 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4227  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  40.74 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1768  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.48 
 
 		 392 aa  82.8  0.000000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2960  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.02 
 
 		 354 aa  82.4  0.000000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0697237  normal  0.577933 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1593  hypothetical protein  35.06 
 
 		 361 aa  78.2  0.0000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1183  hypothetical protein  38.82 
 
 		 275 aa  75.1  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0789  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  51.95 
 
 		 391 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0939  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.26 
 
 		 399 aa  73.2  0.000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211374  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2467  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.36 
 
 		 497 aa  72.8  0.000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8353  hypothetical protein  35.48 
 
 		 366 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4116  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.09 
 
 		 350 aa  70.5  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  normal  0.872293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3735  hypothetical protein  32.45 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.59 
 
 		 368 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4125  hypothetical protein  31.4 
 
 		 290 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7937  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  38.1 
 
 		 419 aa  60.5  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2892  hypothetical protein  35.07 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.001501  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1519  hypothetical protein  42.03 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3787  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.53 
 
 		 426 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499391  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19120  hypothetical protein  40.28 
 
 		 336 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.093214 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>