56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0789 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_0789  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
391 aa  730    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2467  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  44.61 
 
 
497 aa  175  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2892  hypothetical protein  39.59 
 
 
440 aa  149  6e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.001501  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1768  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.34 
 
 
392 aa  124  3e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4227  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  43.12 
 
 
390 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07610  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  34.32 
 
 
330 aa  114  3e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.681594  normal  0.51136 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1183  hypothetical protein  46.45 
 
 
275 aa  112  1.0000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3735  hypothetical protein  35.59 
 
 
350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216223  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4116  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.78 
 
 
350 aa  106  7e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  normal  0.872293 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27530  hypothetical protein  39.06 
 
 
287 aa  102  8e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2960  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.29 
 
 
354 aa  92.4  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0697237  normal  0.577933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8353  hypothetical protein  35.37 
 
 
366 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.59 
 
 
368 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7937  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  37.87 
 
 
419 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0939  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.26 
 
 
399 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211374  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1593  hypothetical protein  41.79 
 
 
361 aa  80.9  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3787  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  39.52 
 
 
426 aa  80.5  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0499391  normal  0.724918 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1811  hypothetical protein  38.37 
 
 
273 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76479  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1466  hypothetical protein  38.89 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1412  hypothetical protein  38.19 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0719  hypothetical protein  32.08 
 
 
333 aa  70.9  0.00000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1430  hypothetical protein  38.19 
 
 
280 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4657  hypothetical protein  51.22 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111613  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3041  hypothetical protein  54.84 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0466154  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13216  hypothetical protein  51.39 
 
 
299 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.35418 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4125  hypothetical protein  28.11 
 
 
290 aa  62  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3491  hypothetical protein  35.33 
 
 
306 aa  61.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0618113  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0955  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.65 
 
 
355 aa  58.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000516657  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1519  hypothetical protein  34.82 
 
 
249 aa  54.7  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2507  ThiF family protein  23.91 
 
 
338 aa  52.4  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.720809 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.14 
 
 
372 aa  50.1  0.00006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.628178  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19120  hypothetical protein  30.08 
 
 
336 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.093214 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0599  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  22.93 
 
 
354 aa  47.4  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10266  E1 ubiquitin activating enzyme (Eurofung)  40.79 
 
 
1033 aa  46.6  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.39577  normal  0.938882 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0611  thiamine biosynthesis protein ThiF  35.53 
 
 
268 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000802075  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1067  thiamine biosynthesis protein ThiF  36.92 
 
 
267 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.451189  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1149  thiamine biosynthesis protein ThiF  35.21 
 
 
265 aa  45.4  0.002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000110097  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1190  thiamine biosynthesis protein ThiF  36.92 
 
 
267 aa  45.4  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0729  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.29 
 
 
219 aa  45.4  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00160483  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2211  HesA/MoeB/ThiF family protein  41.79 
 
 
248 aa  45.1  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02710  molybdopterin biosynthesis protein  33.33 
 
 
237 aa  44.3  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0735  thiamine biosynthesis protein ThiF  35.38 
 
 
267 aa  43.9  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01230  ubiquitin activating enzyme, putative  36.84 
 
 
1015 aa  43.9  0.005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03822  hypothetical protein  43.75 
 
 
251 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03869  thiamine biosynthesis protein ThiF  43.75 
 
 
251 aa  43.9  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4033  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  43.75 
 
 
251 aa  43.9  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948961 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4534  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  43.75 
 
 
251 aa  43.9  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4002  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  43.75 
 
 
251 aa  43.9  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4226  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  43.75 
 
 
251 aa  43.9  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15050  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  38.33 
 
 
242 aa  43.5  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3926  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  21.94 
 
 
364 aa  43.5  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.396526  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5460  thiazole biosynthesis adenylyltransferase ThiF  43.75 
 
 
251 aa  43.5  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.218876 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1138  thiamine biosynthesis protein ThiF  37.5 
 
 
213 aa  43.1  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.119618 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0600  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.77 
 
 
214 aa  43.1  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0519  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding fold protein  43.08 
 
 
245 aa  43.1  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1350  thiF family protein  43.94 
 
 
264 aa  42.7  0.01  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>