More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0387 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_0387  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  100 
 
 
372 aa  736    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.628178  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3926  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.69 
 
 
364 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.396526  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2005  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.54 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1141  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.64 
 
 
266 aa  125  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.158288  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4371  HesA/MoeB/ThiF family protein  25.44 
 
 
367 aa  124  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  3.89161e-22 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1680  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.2 
 
 
395 aa  122  7e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.683784  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0806  dinucleotide-utilizing enzyme  35.08 
 
 
269 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0887502  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2855  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  34.6 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000693391  hitchhiker  0.000000536113 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0663  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.8 
 
 
253 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265316  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3577  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.98 
 
 
390 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.127521  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3607  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.39 
 
 
387 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.156981  normal  0.010154 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3646  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.74 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3493  UBA/THIF-type NAD/FAD binding, MoeZ/MoeB fmaily protein  33.33 
 
 
390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1265  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.27 
 
 
287 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0955  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.6 
 
 
355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000516657  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.81 
 
 
244 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1777  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  32.24 
 
 
396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.1465  normal  0.131801 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1567  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.47 
 
 
247 aa  114  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.0683473 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1822  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.32 
 
 
256 aa  114  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0657406  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0421  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.47 
 
 
270 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.130311 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13136  molybdenum cofactor biosynthesis protein moeB2  31.97 
 
 
389 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.318899 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0728  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.93 
 
 
247 aa  112  8.000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  32.4 
 
 
269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0170878  normal  0.53538 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0336  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.75 
 
 
249 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.458318  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1980  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.06 
 
 
270 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.019523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2240  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.66 
 
 
270 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.590447 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1439  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.74 
 
 
239 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.47 
 
 
443 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.47369 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0654  thiF family protein  33.59 
 
 
248 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.392164  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1350  thiF family protein  30.68 
 
 
264 aa  110  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0113  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.2 
 
 
255 aa  110  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0568  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.93 
 
 
243 aa  110  5e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1847  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.39 
 
 
241 aa  110  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1624  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.98 
 
 
371 aa  109  6e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.100151  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0723  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.86 
 
 
383 aa  110  6e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.71 
 
 
253 aa  109  8.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.92 
 
 
375 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0318  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.45 
 
 
383 aa  108  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.139087 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2122  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.73 
 
 
247 aa  108  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0389221  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0560  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.63 
 
 
254 aa  108  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1270  thiamine biosynthesis protein ThiF  32.1 
 
 
248 aa  108  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1313  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.02 
 
 
364 aa  108  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3943  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.67 
 
 
270 aa  107  4e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000910136  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1867  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.93 
 
 
237 aa  106  6e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00010149  normal  0.587494 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1970  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.11 
 
 
269 aa  106  7e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014844  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0949  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.74 
 
 
383 aa  105  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.96 
 
 
270 aa  105  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.157783  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0548  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  27.31 
 
 
237 aa  105  1e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0599  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  26.52 
 
 
354 aa  105  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0743  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  28.57 
 
 
392 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.754392  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.73 
 
 
377 aa  105  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1047  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
253 aa  105  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  29.01 
 
 
247 aa  105  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0645  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.52 
 
 
268 aa  104  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2022  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.95 
 
 
386 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.236297 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0215  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.33 
 
 
266 aa  104  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0516175 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2211  HesA/MoeB/ThiF family protein  32.2 
 
 
248 aa  104  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3268  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.5 
 
 
280 aa  104  3e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2507  ThiF family protein  29.55 
 
 
338 aa  104  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.415604  normal  0.720809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  35.12 
 
 
251 aa  104  3e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0296  hypothetical protein  31.45 
 
 
377 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0047  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  30.93 
 
 
255 aa  103  6e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1111  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.2 
 
 
259 aa  103  7e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0589  hypothetical protein  28.94 
 
 
236 aa  102  9e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0970373  hitchhiker  0.000644128 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0277  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.51 
 
 
243 aa  102  9e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3578  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  25.74 
 
 
456 aa  102  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0279  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.45 
 
 
273 aa  102  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266697  normal  0.0271151 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4109  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.7 
 
 
269 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4378  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.75 
 
 
261 aa  102  1e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.101331 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0364  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.47 
 
 
266 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2264  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.8 
 
 
258 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.927293  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  31.97 
 
 
257 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1727  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.93 
 
 
266 aa  101  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0089  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.75 
 
 
266 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4592  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.33 
 
 
392 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.418799  normal  0.0841628 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0454  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  30.29 
 
 
393 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.427252  decreased coverage  0.00000325534 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4234  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.37 
 
 
263 aa  101  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0035256 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4770  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  27.97 
 
 
256 aa  101  3e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000133874 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1380  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.45 
 
 
271 aa  100  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0137  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.35 
 
 
254 aa  100  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.75 
 
 
254 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0096  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  27.17 
 
 
256 aa  100  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0728  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.2 
 
 
388 aa  99.8  8e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.652305  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1394  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.28 
 
 
278 aa  99.4  8e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00932  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.08 
 
 
379 aa  99.4  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0383  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  29.05 
 
 
393 aa  99.4  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0617  molybdenum cofactor biosynthesis protein  33.47 
 
 
265 aa  99.4  9e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.230334  normal  0.726284 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4224  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.33 
 
 
255 aa  99.4  9e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06090  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  33.08 
 
 
379 aa  99.4  9e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0130  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  28.57 
 
 
252 aa  98.6  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3803  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  28.87 
 
 
390 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.209325  normal  0.526883 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0480  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.96 
 
 
239 aa  98.6  1e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.116594  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0188  hypothetical protein  31.92 
 
 
252 aa  98.6  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430925  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61670  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  34.75 
 
 
252 aa  99  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.100571 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1261  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.35 
 
 
246 aa  99  1e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2539  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.53 
 
 
270 aa  99  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.214496  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0362  adenylyl transferase  30.12 
 
 
250 aa  99  1e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2830  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.8 
 
 
254 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2183  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  29.44 
 
 
245 aa  98.6  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0127  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  27.97 
 
 
256 aa  98.2  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>