25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4125 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_4125  hypothetical protein  100 
 
 
290 aa  577  1e-164  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3735  hypothetical protein  32.06 
 
 
350 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216223  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4116  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.36 
 
 
350 aa  103  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  normal  0.872293 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1768  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.88 
 
 
392 aa  76.6  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8353  hypothetical protein  28.77 
 
 
366 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2960  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.3 
 
 
354 aa  70.5  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0697237  normal  0.577933 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4227  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  40.87 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2892  hypothetical protein  28.35 
 
 
440 aa  70.5  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.001501  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1811  hypothetical protein  29.62 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76479  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4657  hypothetical protein  28.47 
 
 
283 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111613  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1593  hypothetical protein  29.47 
 
 
361 aa  65.5  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1183  hypothetical protein  31.66 
 
 
275 aa  59.3  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2467  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.96 
 
 
497 aa  59.7  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13216  hypothetical protein  30.88 
 
 
299 aa  55.8  0.0000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.35418 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0939  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.62 
 
 
399 aa  55.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211374  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1430  hypothetical protein  31.3 
 
 
280 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1412  hypothetical protein  31.3 
 
 
280 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1466  hypothetical protein  30.87 
 
 
280 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1519  hypothetical protein  31.98 
 
 
249 aa  52.4  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0789  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.55 
 
 
391 aa  52  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3041  hypothetical protein  30.18 
 
 
298 aa  51.6  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0466154  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3491  hypothetical protein  25.42 
 
 
306 aa  50.4  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0618113  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0935  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.65 
 
 
368 aa  50.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.42742  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7937  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  30.17 
 
 
419 aa  46.6  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07610  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  28.69 
 
 
330 aa  45.1  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.681594  normal  0.51136 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>