26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1519 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1519  hypothetical protein  100 
 
 		 249 aa  479  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2892  hypothetical protein  41.3 
 
 		 440 aa  81.3  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.001501  normal  0.0367293 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1768  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  40.98 
 
 		 392 aa  79.3  0.00000000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2960  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  41.03 
 
 		 354 aa  70.5  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0697237  normal  0.577933 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1811  hypothetical protein  32.32 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.76479  normal  0.0591067 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4227  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  40.87 
 
 		 390 aa  65.9  0.0000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1183  hypothetical protein  37.24 
 
 		 275 aa  63.5  0.000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8353  hypothetical protein  39.09 
 
 		 366 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.213403  normal  0.739264 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3735  hypothetical protein  38.38 
 
 		 350 aa  62  0.000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.216223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1593  hypothetical protein  38.74 
 
 		 361 aa  61.2  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.154716 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2467  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.57 
 
 		 497 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0939  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.35 
 
 		 399 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.211374  normal  0.930248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4125  hypothetical protein  31.98 
 
 		 290 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7937  UBA/ThiF-type NAD/FAD binding protein  36.07 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27530  hypothetical protein  37.14 
 
 		 287 aa  55.8  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1466  hypothetical protein  31.91 
 
 		 280 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1412  hypothetical protein  31.21 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1430  hypothetical protein  31.21 
 
 		 280 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4116  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.09 
 
 		 350 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.533278  normal  0.872293 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4657  hypothetical protein  28.78 
 
 		 283 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.111613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07610  molybdopterin/thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing protein  33.05 
 
 		 330 aa  52  0.000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.681594  normal  0.51136 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0789  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.82 
 
 		 391 aa  50.8  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0719  hypothetical protein  36.61 
 
 		 333 aa  49.3  0.00005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3491  hypothetical protein  27.43 
 
 		 306 aa  48.1  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0618113  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13216  hypothetical protein  30.5 
 
 		 299 aa  46.2  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.35418 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3041  hypothetical protein  43.33 
 
 		 298 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0466154  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>