19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_0959 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_0959  hypothetical protein  100 
 
 		 471 aa  905    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.658844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1753  hypothetical protein  59.57 
 
 		 562 aa  450  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179744  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3547  hypothetical protein  44.12 
 
 		 496 aa  300  5e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.884895  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0975  hypothetical protein  46.52 
 
 		 493 aa  283  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1364  hypothetical protein  45.31 
 
 		 462 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8783  hypothetical protein  46.03 
 
 		 468 aa  277  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4100  hypothetical protein  47.85 
 
 		 532 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0729  hypothetical protein  43.86 
 
 		 485 aa  268  1e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.952258  normal  0.0282933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8624  hypothetical protein  42.49 
 
 		 509 aa  267  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3173  hypothetical protein  41.7 
 
 		 497 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6255  hypothetical protein  41.09 
 
 		 449 aa  232  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1855  hypothetical protein  36.24 
 
 		 827 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.152269  decreased coverage  0.00336297 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  37.01 
 
 		 749 aa  180  4e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3062  hypothetical protein  36.36 
 
 		 589 aa  180  4e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.319851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3375  hypothetical protein  36.1 
 
 		 507 aa  151  3e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5897  hypothetical protein  35.53 
 
 		 547 aa  108  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0016856  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0718  hypothetical protein  32.88 
 
 		 470 aa  87.8  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364922  normal  0.695785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0031  Protoporphyrinogen oxidase-like protein  23.63 
 
 		 1033 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000538665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0053  hypothetical protein  21.99 
 
 		 484 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>