19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4100 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4100  hypothetical protein  100 
 
 
532 aa  1031    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3547  hypothetical protein  44.4 
 
 
496 aa  325  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.884895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8624  hypothetical protein  41.58 
 
 
509 aa  316  6e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388078  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3173  hypothetical protein  43.86 
 
 
497 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0975  hypothetical protein  47.67 
 
 
493 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0959  hypothetical protein  47.58 
 
 
471 aa  288  2e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.658844  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0729  hypothetical protein  44.54 
 
 
485 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.952258  normal  0.0282933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1753  hypothetical protein  42.86 
 
 
562 aa  263  8e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179744  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8783  hypothetical protein  43.45 
 
 
468 aa  253  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1364  hypothetical protein  40.22 
 
 
462 aa  246  8e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6255  hypothetical protein  38.55 
 
 
449 aa  221  3e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3062  hypothetical protein  34.99 
 
 
589 aa  206  1e-51  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.319851  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1855  hypothetical protein  33.77 
 
 
827 aa  197  3e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.152269  decreased coverage  0.00336297 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  33.19 
 
 
749 aa  169  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3375  hypothetical protein  36.93 
 
 
507 aa  160  4e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5897  hypothetical protein  34.15 
 
 
547 aa  106  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0016856  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0718  hypothetical protein  32.43 
 
 
470 aa  100  9e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364922  normal  0.695785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0049  hypothetical protein  30 
 
 
490 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02510  hypothetical protein  33.33 
 
 
440 aa  44.7  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>