18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3375 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3375  hypothetical protein  100 
 
 		 507 aa  985    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3547  hypothetical protein  35.84 
 
 		 496 aa  207  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.884895  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0729  hypothetical protein  37.42 
 
 		 485 aa  204  3e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.952258  normal  0.0282933 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3062  hypothetical protein  35.81 
 
 		 589 aa  201  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.319851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1855  hypothetical protein  35.83 
 
 		 827 aa  196  6e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.152269  decreased coverage  0.00336297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8624  hypothetical protein  32.6 
 
 		 509 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3173  hypothetical protein  33.19 
 
 		 497 aa  179  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0959  hypothetical protein  35.89 
 
 		 471 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.658844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1364  hypothetical protein  35.99 
 
 		 462 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4100  hypothetical protein  36.59 
 
 		 532 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1753  hypothetical protein  36.17 
 
 		 562 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179744  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6255  hypothetical protein  39.78 
 
 		 449 aa  166  6.9999999999999995e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  32.59 
 
 		 749 aa  157  4e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0975  hypothetical protein  33.7 
 
 		 493 aa  155  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8783  hypothetical protein  33.97 
 
 		 468 aa  152  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0718  hypothetical protein  29.42 
 
 		 470 aa  104  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364922  normal  0.695785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5897  hypothetical protein  31.98 
 
 		 547 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0016856  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02510  hypothetical protein  21.43 
 
 		 440 aa  45.1  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>