18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1855 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_1855  hypothetical protein  100 
 
 		 827 aa  1611    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.152269  decreased coverage  0.00336297 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3062  hypothetical protein  58.78 
 
 		 589 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.319851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3547  hypothetical protein  34.42 
 
 		 496 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.884895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1753  hypothetical protein  36.73 
 
 		 562 aa  201  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179744  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  34.32 
 
 		 749 aa  192  2.9999999999999997e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8624  hypothetical protein  32.67 
 
 		 509 aa  182  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3173  hypothetical protein  32.56 
 
 		 497 aa  181  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0959  hypothetical protein  36.5 
 
 		 471 aa  180  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.658844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6255  hypothetical protein  41.81 
 
 		 449 aa  180  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4100  hypothetical protein  32.44 
 
 		 532 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3375  hypothetical protein  36.38 
 
 		 507 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0729  hypothetical protein  35.05 
 
 		 485 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.952258  normal  0.0282933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0975  hypothetical protein  35.17 
 
 		 493 aa  164  5.0000000000000005e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5897  hypothetical protein  37.2 
 
 		 547 aa  156  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0016856  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1364  hypothetical protein  33.26 
 
 		 462 aa  142  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8783  hypothetical protein  31.96 
 
 		 468 aa  141  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0718  hypothetical protein  33.33 
 
 		 470 aa  105  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364922  normal  0.695785 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1632  large adhesin  28.62 
 
 		 2914 aa  57.8  0.0000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>