19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3547 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3547  hypothetical protein  100 
 
 
496 aa  978    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.884895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8624  hypothetical protein  49.67 
 
 
509 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388078  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0975  hypothetical protein  48.99 
 
 
493 aa  351  2e-95  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3173  hypothetical protein  46.64 
 
 
497 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0729  hypothetical protein  43.08 
 
 
485 aa  310  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.952258  normal  0.0282933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1364  hypothetical protein  44.52 
 
 
462 aa  303  6.000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8783  hypothetical protein  47.8 
 
 
468 aa  297  3e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0959  hypothetical protein  46.19 
 
 
471 aa  292  1e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.658844  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4100  hypothetical protein  45.08 
 
 
532 aa  281  3e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1753  hypothetical protein  41.98 
 
 
562 aa  261  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179744  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6255  hypothetical protein  41.87 
 
 
449 aa  251  3e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1855  hypothetical protein  35.01 
 
 
827 aa  206  1e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.152269  decreased coverage  0.00336297 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3062  hypothetical protein  34.4 
 
 
589 aa  171  2e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.319851  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3375  hypothetical protein  36.38 
 
 
507 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  30.04 
 
 
749 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5897  hypothetical protein  30.46 
 
 
547 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0016856  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0718  hypothetical protein  32.98 
 
 
470 aa  99.4  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364922  normal  0.695785 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02510  hypothetical protein  21.99 
 
 
440 aa  59.3  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0049  hypothetical protein  24.91 
 
 
490 aa  44.7  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>