18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6255 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6255  hypothetical protein  100 
 
 		 449 aa  883    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3547  hypothetical protein  41.97 
 
 		 496 aa  273  3e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.884895  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3173  hypothetical protein  39.86 
 
 		 497 aa  261  2e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8624  hypothetical protein  39.73 
 
 		 509 aa  259  9e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0975  hypothetical protein  43.13 
 
 		 493 aa  256  5e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1364  hypothetical protein  42.82 
 
 		 462 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0729  hypothetical protein  41.45 
 
 		 485 aa  239  1e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.952258  normal  0.0282933 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0959  hypothetical protein  40.81 
 
 		 471 aa  236  8e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.658844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8783  hypothetical protein  40.47 
 
 		 468 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1753  hypothetical protein  40.47 
 
 		 562 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179744  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4100  hypothetical protein  39.62 
 
 		 532 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1855  hypothetical protein  36.67 
 
 		 827 aa  191  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.152269  decreased coverage  0.00336297 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3062  hypothetical protein  34.66 
 
 		 589 aa  189  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.319851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  36.16 
 
 		 749 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3375  hypothetical protein  39.93 
 
 		 507 aa  154  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5897  hypothetical protein  34.85 
 
 		 547 aa  113  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0016856  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0718  hypothetical protein  30.83 
 
 		 470 aa  104  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364922  normal  0.695785 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02510  hypothetical protein  23.69 
 
 		 440 aa  50.8  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>