17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8624 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8624  hypothetical protein  100 
 
 		 509 aa  1023    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3173  hypothetical protein  62.79 
 
 		 497 aa  565  1e-160  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0975  hypothetical protein  52.63 
 
 		 493 aa  401  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3547  hypothetical protein  49.01 
 
 		 496 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.884895  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4100  hypothetical protein  41.45 
 
 		 532 aa  277  3e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0729  hypothetical protein  41.7 
 
 		 485 aa  274  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.952258  normal  0.0282933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1364  hypothetical protein  39.02 
 
 		 462 aa  266  7e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8783  hypothetical protein  41.95 
 
 		 468 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1753  hypothetical protein  40.61 
 
 		 562 aa  253  7e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179744  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0959  hypothetical protein  41.75 
 
 		 471 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.658844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6255  hypothetical protein  39.73 
 
 		 449 aa  238  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1855  hypothetical protein  32.36 
 
 		 827 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.152269  decreased coverage  0.00336297 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  31.24 
 
 		 749 aa  164  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3375  hypothetical protein  32.69 
 
 		 507 aa  157  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3062  hypothetical protein  29.94 
 
 		 589 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.319851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5897  hypothetical protein  31.53 
 
 		 547 aa  105  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0016856  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0718  hypothetical protein  28.91 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364922  normal  0.695785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>