17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3173 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3173  hypothetical protein  100 
 
 
497 aa  1002    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8624  hypothetical protein  62.38 
 
 
509 aa  586  1e-166  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388078  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0975  hypothetical protein  52.33 
 
 
493 aa  400  9.999999999999999e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3547  hypothetical protein  46.64 
 
 
496 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.884895  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0729  hypothetical protein  44.42 
 
 
485 aa  310  5e-83  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.952258  normal  0.0282933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4100  hypothetical protein  43.38 
 
 
532 aa  291  1e-77  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1364  hypothetical protein  42.27 
 
 
462 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0959  hypothetical protein  42.21 
 
 
471 aa  262  1e-68  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.658844  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1753  hypothetical protein  38.57 
 
 
562 aa  246  9e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179744  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6255  hypothetical protein  39.68 
 
 
449 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8783  hypothetical protein  39.61 
 
 
468 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1855  hypothetical protein  32.06 
 
 
827 aa  179  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.152269  decreased coverage  0.00336297 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3062  hypothetical protein  30.47 
 
 
589 aa  167  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.319851  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  29.68 
 
 
749 aa  156  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3375  hypothetical protein  33.04 
 
 
507 aa  152  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5897  hypothetical protein  29.61 
 
 
547 aa  91.3  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0016856  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0718  hypothetical protein  30.13 
 
 
470 aa  77.8  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364922  normal  0.695785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>