19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5897 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5897  hypothetical protein  100 
 
 		 547 aa  1053    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0016856  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0718  hypothetical protein  58.39 
 
 		 470 aa  403  1e-111  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364922  normal  0.695785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1855  hypothetical protein  32.91 
 
 		 827 aa  166  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.152269  decreased coverage  0.00336297 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3062  hypothetical protein  34.25 
 
 		 589 aa  156  7e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.319851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  31.34 
 
 		 749 aa  134  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6255  hypothetical protein  32.57 
 
 		 449 aa  128  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3547  hypothetical protein  31.93 
 
 		 496 aa  124  4e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.884895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8624  hypothetical protein  29.98 
 
 		 509 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0975  hypothetical protein  32.24 
 
 		 493 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1364  hypothetical protein  33.73 
 
 		 462 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3173  hypothetical protein  29.61 
 
 		 497 aa  114  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0959  hypothetical protein  32.92 
 
 		 471 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.658844  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0729  hypothetical protein  31.97 
 
 		 485 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.952258  normal  0.0282933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4100  hypothetical protein  31.09 
 
 		 532 aa  111  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1753  hypothetical protein  30.25 
 
 		 562 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179744  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8783  hypothetical protein  28.86 
 
 		 468 aa  97.1  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3375  hypothetical protein  30.36 
 
 		 507 aa  93.6  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0049  hypothetical protein  23.1 
 
 		 490 aa  51.2  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0032  hypothetical protein  23 
 
 		 506 aa  48.5  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0423403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>