18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0718 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0718  hypothetical protein  100 
 
 		 470 aa  905    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364922  normal  0.695785 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5897  hypothetical protein  58.52 
 
 		 547 aa  387  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0016856  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1855  hypothetical protein  34.9 
 
 		 827 aa  146  9e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.152269  decreased coverage  0.00336297 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3062  hypothetical protein  32.99 
 
 		 589 aa  139  1e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.319851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3547  hypothetical protein  34.01 
 
 		 496 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.884895  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3375  hypothetical protein  31.18 
 
 		 507 aa  125  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  31.06 
 
 		 749 aa  124  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0729  hypothetical protein  36.84 
 
 		 485 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.952258  normal  0.0282933 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3173  hypothetical protein  29.31 
 
 		 497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4100  hypothetical protein  31.08 
 
 		 532 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6255  hypothetical protein  31.82 
 
 		 449 aa  113  8.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0975  hypothetical protein  32.12 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0959  hypothetical protein  32.88 
 
 		 471 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.658844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8624  hypothetical protein  29.83 
 
 		 509 aa  106  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1364  hypothetical protein  30.65 
 
 		 462 aa  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1753  hypothetical protein  31.61 
 
 		 562 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179744  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8783  hypothetical protein  28.24 
 
 		 468 aa  93.6  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0032  hypothetical protein  23.16 
 
 		 506 aa  46.2  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0423403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>