17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3062 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3062  hypothetical protein  100 
 
 		 589 aa  1151    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.319851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1855  hypothetical protein  65.7 
 
 		 827 aa  547  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.152269  decreased coverage  0.00336297 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3547  hypothetical protein  34.72 
 
 		 496 aa  193  6e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.884895  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4100  hypothetical protein  34.06 
 
 		 532 aa  187  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0729  hypothetical protein  35.77 
 
 		 485 aa  180  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.952258  normal  0.0282933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6255  hypothetical protein  35.45 
 
 		 449 aa  178  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3173  hypothetical protein  30.75 
 
 		 497 aa  178  3e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1753  hypothetical protein  33.54 
 
 		 562 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179744  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0959  hypothetical protein  37 
 
 		 471 aa  170  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.658844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  32.34 
 
 		 749 aa  164  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0975  hypothetical protein  35.11 
 
 		 493 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3375  hypothetical protein  35.1 
 
 		 507 aa  158  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8624  hypothetical protein  31.12 
 
 		 509 aa  157  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1364  hypothetical protein  35.24 
 
 		 462 aa  154  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8783  hypothetical protein  34.1 
 
 		 468 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5897  hypothetical protein  34.04 
 
 		 547 aa  140  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0016856  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0718  hypothetical protein  31.08 
 
 		 470 aa  117  7.999999999999999e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364922  normal  0.695785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>