17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1753 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1753  hypothetical protein  100 
 
 		 562 aa  1100    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179744  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0959  hypothetical protein  59.57 
 
 		 471 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.658844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0975  hypothetical protein  45.43 
 
 		 493 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8624  hypothetical protein  40.61 
 
 		 509 aa  285  2.0000000000000002e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3547  hypothetical protein  41.94 
 
 		 496 aa  282  1e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.884895  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4100  hypothetical protein  42.05 
 
 		 532 aa  267  4e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3173  hypothetical protein  38.57 
 
 		 497 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1364  hypothetical protein  42.99 
 
 		 462 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8783  hypothetical protein  40.84 
 
 		 468 aa  246  6e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0729  hypothetical protein  43.43 
 
 		 485 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.952258  normal  0.0282933 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1855  hypothetical protein  36.48 
 
 		 827 aa  231  2e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.152269  decreased coverage  0.00336297 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6255  hypothetical protein  40.76 
 
 		 449 aa  222  9.999999999999999e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3062  hypothetical protein  34.1 
 
 		 589 aa  186  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.319851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3375  hypothetical protein  35.25 
 
 		 507 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  33.63 
 
 		 749 aa  155  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5897  hypothetical protein  31.83 
 
 		 547 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0016856  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0718  hypothetical protein  29.9 
 
 		 470 aa  85.5  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364922  normal  0.695785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>