19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1364 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1364  hypothetical protein  100 
 
 		 462 aa  904    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0729  hypothetical protein  66.44 
 
 		 485 aa  509  1e-143  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.952258  normal  0.0282933 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3547  hypothetical protein  44.47 
 
 		 496 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.884895  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3173  hypothetical protein  44.17 
 
 		 497 aa  318  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8624  hypothetical protein  41.39 
 
 		 509 aa  302  9e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388078  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0959  hypothetical protein  46.02 
 
 		 471 aa  281  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.658844  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0975  hypothetical protein  44.81 
 
 		 493 aa  263  6.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6255  hypothetical protein  43.03 
 
 		 449 aa  259  5.0000000000000005e-68  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4100  hypothetical protein  40.47 
 
 		 532 aa  249  8e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1753  hypothetical protein  43.11 
 
 		 562 aa  248  2e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179744  normal  0.195668 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8783  hypothetical protein  41.02 
 
 		 468 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3375  hypothetical protein  35.99 
 
 		 507 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3062  hypothetical protein  34.32 
 
 		 589 aa  164  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.319851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1855  hypothetical protein  33.33 
 
 		 827 aa  162  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.152269  decreased coverage  0.00336297 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33890  glycosyl transferase  31.25 
 
 		 749 aa  159  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.47583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5897  hypothetical protein  31.94 
 
 		 547 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.0016856  normal  0.41818 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0718  hypothetical protein  29.45 
 
 		 470 aa  89.7  9e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364922  normal  0.695785 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02510  hypothetical protein  21.6 
 
 		 440 aa  50.4  0.00006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0032  hypothetical protein  31.3 
 
 		 506 aa  45.1  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0423403  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>