21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0504 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0504  hypothetical protein  100 
 
 
451 aa  900    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0210  hypothetical protein  28.54 
 
 
444 aa  160  5e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2270  hypothetical protein  22.14 
 
 
464 aa  83.2  0.000000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.328627  normal  0.114175 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0126  hypothetical protein  20.75 
 
 
454 aa  77.4  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0255441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3082  hypothetical protein  22.82 
 
 
417 aa  77  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4086  hypothetical protein  24.16 
 
 
520 aa  69.7  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0146157  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1196  hypothetical protein  22.25 
 
 
417 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1964  hypothetical protein  23.53 
 
 
511 aa  68.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.611513  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1383  hypothetical protein  22.22 
 
 
487 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229216  normal  0.586845 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2584  hypothetical protein  22.78 
 
 
446 aa  67  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000463942  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2797  hypothetical protein  23 
 
 
428 aa  67  0.0000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91225  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2169  hypothetical protein  23.5 
 
 
513 aa  65.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2886  hypothetical protein  23.43 
 
 
518 aa  62.8  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770972  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3425  hypothetical protein  23.08 
 
 
511 aa  60.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.955641  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3372  hypothetical protein  21.46 
 
 
455 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.315393 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0278  hypothetical protein  18.49 
 
 
483 aa  58.2  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6214  hypothetical protein  24.25 
 
 
544 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1235  hypothetical protein  21.32 
 
 
488 aa  53.1  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.212609  normal  0.0713151 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2998  hypothetical protein  22.5 
 
 
495 aa  47.4  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0265  hypothetical protein  21.82 
 
 
457 aa  44.7  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1664  hypothetical protein  18.65 
 
 
484 aa  43.9  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0854698  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>