17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2886 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2459  hypothetical protein  80.89 
 
 		 518 aa  813    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.679548  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2169  hypothetical protein  63.11 
 
 		 513 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2886  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  1031    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770972  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3425  hypothetical protein  57.5 
 
 		 511 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.955641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6214  hypothetical protein  61.97 
 
 		 544 aa  578  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1964  hypothetical protein  57.43 
 
 		 511 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.611513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4086  hypothetical protein  54.42 
 
 		 520 aa  565  1e-160  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0146157  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2721  hypothetical protein  20.24 
 
 		 489 aa  84  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1666  hypothetical protein  20 
 
 		 468 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0504  hypothetical protein  23.43 
 
 		 451 aa  62.8  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2584  hypothetical protein  20.9 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000463942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1383  hypothetical protein  20.49 
 
 		 487 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229216  normal  0.586845 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0265  hypothetical protein  23.55 
 
 		 457 aa  47.4  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.504961 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0210  hypothetical protein  19.11 
 
 		 444 aa  47  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2998  hypothetical protein  20 
 
 		 495 aa  47  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2270  hypothetical protein  21.07 
 
 		 464 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.328627  normal  0.114175 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2751  late control D family protein  30.61 
 
 		 366 aa  43.5  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000516519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>