19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2998 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2998  hypothetical protein  100 
 
 		 495 aa  1000    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2721  hypothetical protein  27.08 
 
 		 489 aa  213  3.9999999999999995e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00726041 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0210  hypothetical protein  22.99 
 
 		 444 aa  74.7  0.000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0278  hypothetical protein  19.14 
 
 		 483 aa  69.7  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3425  hypothetical protein  20.65 
 
 		 511 aa  63.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.955641  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2584  hypothetical protein  19.76 
 
 		 446 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000463942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3082  hypothetical protein  21.58 
 
 		 417 aa  58.9  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2169  hypothetical protein  20.4 
 
 		 513 aa  57.4  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.992488 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1196  hypothetical protein  21.03 
 
 		 417 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3372  hypothetical protein  23.92 
 
 		 455 aa  54.7  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.315393 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4086  hypothetical protein  19.96 
 
 		 520 aa  54.3  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0146157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0126  hypothetical protein  20.22 
 
 		 454 aa  50.1  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0255441  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1964  hypothetical protein  20.13 
 
 		 511 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.611513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2797  hypothetical protein  20 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.91225  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2886  hypothetical protein  20.1 
 
 		 518 aa  47.4  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.770972  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0504  hypothetical protein  22.5 
 
 		 451 aa  47  0.0008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1666  hypothetical protein  19.35 
 
 		 468 aa  46.6  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2459  hypothetical protein  19.07 
 
 		 518 aa  46.6  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.679548  normal  0.300515 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1383  hypothetical protein  20 
 
 		 487 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.229216  normal  0.586845 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>